More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0493 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  69.76 
 
 		 211 aa  315  5e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  69.12 
 
 		 212 aa  296  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  64.62 
 
 		 212 aa  288  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  67.49 
 
 		 208 aa  288  6e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  65.05 
 
 		 216 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  62.8 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  52.55 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.85 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  50.77 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  50.26 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  49.49 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  49.49 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.33 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  51.83 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.28 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  52.08 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  49.75 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.75 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.75 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2079  endonuclease III  50 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  50.52 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  50.25 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  52.6 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  49.74 
 
 		 213 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  49.74 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  47.03 
 
 		 212 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  49.74 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  49.74 
 
 		 215 aa  207  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  50.25 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.5 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  46.89 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  49.74 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  50.52 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  52.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  52.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.4 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.75 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  52.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  52.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  49.25 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  52.08 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  52.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  52.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  50.27 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  52.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  46.63 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  51.04 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  49.21 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  44.24 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  46.58 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.76 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.75 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  49.74 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.64 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  51.04 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  51.28 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  50 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  46.58 
 
 		 335 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.01 
 
 		 218 aa  204  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  51.56 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.21 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.6 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  47.6 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  48.44 
 
 		 219 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  48.95 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  45.66 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  50.52 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  48.31 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  48.96 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.31 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.69 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.47 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  51.04 
 
 		 215 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  47.12 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  51.81 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.48 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  50.52 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  50.52 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  48.73 
 
 		 210 aa  201  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  47.14 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  47.12 
 
 		 211 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.58 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.67 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  48.44 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  50.52 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  46.67 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  48.73 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  50 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  50 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  47.85 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  50 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  48.17 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  48.17 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  48.17 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  46.19 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  44.93 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  48.17 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  48.17 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  48.73 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>