More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0561 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  100 
 
 		 233 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  92.7 
 
 		 270 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  93.13 
 
 		 233 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  79.37 
 
 		 287 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  78.12 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  80.47 
 
 		 249 aa  344  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  68.63 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  65.35 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  63.81 
 
 		 274 aa  274  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  62.33 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  60.58 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  63.86 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  62.44 
 
 		 214 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  63.73 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  62.32 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  59.74 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.72 
 
 		 218 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  61.46 
 
 		 252 aa  261  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  61.14 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  60.56 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  60.58 
 
 		 230 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  62.56 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  60.09 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  63.55 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  62.69 
 
 		 213 aa  258  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  61.39 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  62.38 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  61.88 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  62.38 
 
 		 249 aa  256  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  57.21 
 
 		 213 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  57.35 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  56.54 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  59.05 
 
 		 252 aa  252  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  58.77 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.22 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  58.25 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  60 
 
 		 222 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  57.77 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  58.37 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.65 
 
 		 211 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.14 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  59.02 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  58.91 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.71 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  59.9 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  54.55 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  59.7 
 
 		 214 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.02 
 
 		 240 aa  244  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  59.2 
 
 		 214 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  59.8 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  53.85 
 
 		 213 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  59.51 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  55.29 
 
 		 213 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  54.76 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  54.81 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  54.55 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  59.51 
 
 		 214 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  54.29 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  54.33 
 
 		 211 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  58.21 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  54.15 
 
 		 217 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.02 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  54.55 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  53.85 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  58.21 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  55.02 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  55.5 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  57.71 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  58.62 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  56.46 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  55.02 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  58.21 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  58.21 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  57.14 
 
 		 226 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  58.21 
 
 		 214 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  57.71 
 
 		 214 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  54.17 
 
 		 335 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  56.46 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.71 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  57.71 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  53.85 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  55.02 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  53.85 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  53.85 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  53.85 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  53.85 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  55.02 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  53.85 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>