More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3289 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  69.55 
 
 		 252 aa  317  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  64.29 
 
 		 261 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  63.09 
 
 		 248 aa  299  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  69 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  68.14 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  65.87 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  65.74 
 
 		 236 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  60.08 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  62.78 
 
 		 262 aa  293  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  69.31 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  61.88 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.74 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  62.78 
 
 		 260 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  61.02 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  63.23 
 
 		 260 aa  287  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  66.5 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  63.33 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  66.67 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  66.18 
 
 		 260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  66.67 
 
 		 218 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  64.9 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  66.83 
 
 		 214 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  67.98 
 
 		 359 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  64.39 
 
 		 214 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  64.25 
 
 		 215 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  64.22 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  64.39 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  63.9 
 
 		 214 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  64.71 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  64.25 
 
 		 249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  63.41 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  60.19 
 
 		 212 aa  269  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  62.75 
 
 		 214 aa  268  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.2 
 
 		 210 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  62.09 
 
 		 215 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  61.14 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.62 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.66 
 
 		 214 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  57.92 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  59.24 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  60 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  60 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  60 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  60 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  60 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  60 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  60 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.56 
 
 		 212 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.75 
 
 		 211 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  62.87 
 
 		 222 aa  261  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  58.29 
 
 		 214 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.38 
 
 		 229 aa  261  8.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  58.29 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  58.77 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  63.24 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  59.51 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.29 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  58.77 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  61.76 
 
 		 230 aa  258  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  58.77 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  57.85 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  59.02 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  62 
 
 		 213 aa  257  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.82 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  58.82 
 
 		 217 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  61.84 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.35 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  59.02 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  52.24 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  60.5 
 
 		 228 aa  254  8e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  59.11 
 
 		 211 aa  254  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  57.21 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  60 
 
 		 228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  59.42 
 
 		 216 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  58.62 
 
 		 211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  57.92 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.94 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  60.1 
 
 		 212 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  59.91 
 
 		 214 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  61.39 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  58.82 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  59.11 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.17 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  60.48 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  58.94 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  59.11 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  59.13 
 
 		 212 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  58.96 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.96 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2465  endonuclease III  59.33 
 
 		 212 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  60.29 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  58.71 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  57 
 
 		 213 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  58.17 
 
 		 212 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  56.93 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  57.21 
 
 		 212 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  60.2 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.2 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.71 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>