More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2517 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  99.07 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  87.74 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  89.42 
 
 		 226 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  82.08 
 
 		 212 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2465  endonuclease III  78.67 
 
 		 212 aa  348  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  77.36 
 
 		 212 aa  347  8e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2079  endonuclease III  76.89 
 
 		 214 aa  343  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  75.81 
 
 		 215 aa  342  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  74.76 
 
 		 217 aa  337  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  73.58 
 
 		 212 aa  328  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  70.75 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  71.23 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  69.3 
 
 		 215 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  70.28 
 
 		 214 aa  311  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  68.87 
 
 		 214 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  71.08 
 
 		 214 aa  308  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  69.61 
 
 		 214 aa  305  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  69.12 
 
 		 214 aa  304  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  69.27 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  69.27 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  69.12 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  69.27 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  69.27 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  69.27 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  69.27 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  69.27 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  68.25 
 
 		 228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  67.77 
 
 		 228 aa  300  8.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  67.45 
 
 		 219 aa  300  9e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  67.45 
 
 		 219 aa  300  9e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  68.42 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  68.63 
 
 		 214 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  69.12 
 
 		 225 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  68.42 
 
 		 212 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  69.95 
 
 		 212 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  68.66 
 
 		 219 aa  297  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  66.83 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  68.9 
 
 		 210 aa  296  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  67.16 
 
 		 214 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  67.65 
 
 		 214 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  69.15 
 
 		 212 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  66.83 
 
 		 214 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  69.65 
 
 		 212 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  66.35 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  67.3 
 
 		 230 aa  295  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  67.16 
 
 		 214 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  69.65 
 
 		 212 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  67.16 
 
 		 214 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  67.16 
 
 		 214 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  69.15 
 
 		 212 aa  294  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  69.65 
 
 		 212 aa  294  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  67.63 
 
 		 236 aa  294  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  67.16 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  65.38 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  68.16 
 
 		 212 aa  291  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  66.5 
 
 		 211 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  67.66 
 
 		 212 aa  287  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  69.15 
 
 		 335 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  65.07 
 
 		 212 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  63.64 
 
 		 211 aa  285  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  65.17 
 
 		 226 aa  284  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  65.24 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  64.9 
 
 		 211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  65.55 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  63.16 
 
 		 229 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  65.5 
 
 		 215 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  66.84 
 
 		 211 aa  279  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  61.43 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  61.43 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  67.35 
 
 		 213 aa  277  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  67.35 
 
 		 213 aa  277  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  67.35 
 
 		 213 aa  277  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  65.17 
 
 		 235 aa  277  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  65.83 
 
 		 211 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  66.84 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  63.9 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  63.33 
 
 		 211 aa  275  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  66.33 
 
 		 211 aa  274  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  63.94 
 
 		 231 aa  274  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  65.82 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  65.82 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  65.82 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  65.82 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  65.82 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  62.07 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  65.31 
 
 		 213 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  64.18 
 
 		 211 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  62.02 
 
 		 231 aa  271  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.5 
 
 		 231 aa  271  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  62.2 
 
 		 210 aa  270  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  64.47 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  63.27 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>