More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0597 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  99.57 
 
 		 270 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  93.13 
 
 		 233 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  78.92 
 
 		 287 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  77.23 
 
 		 248 aa  341  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  79.53 
 
 		 249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  67.65 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  65.67 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  62.86 
 
 		 214 aa  268  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  62.79 
 
 		 261 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.68 
 
 		 268 aa  265  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  59.72 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.38 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  62.02 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.24 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  58.08 
 
 		 233 aa  261  8e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  63.73 
 
 		 258 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  63.77 
 
 		 359 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  60.56 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  61.84 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  60.09 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  61.9 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  64.36 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  60.19 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  61.39 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  61.54 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  62.56 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  62.25 
 
 		 236 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  62.38 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  58.65 
 
 		 213 aa  255  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  61.39 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  60.19 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  62.19 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  57.75 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  62.07 
 
 		 213 aa  252  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.37 
 
 		 210 aa  251  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  58.94 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.98 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.77 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  58.65 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  59.52 
 
 		 262 aa  248  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  58.17 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  60.4 
 
 		 213 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  58.29 
 
 		 214 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  59.41 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  59.61 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.51 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  55.45 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  59.7 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  60.59 
 
 		 212 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  59.33 
 
 		 214 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.61 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  56.93 
 
 		 213 aa  244  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  59.33 
 
 		 214 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  58.71 
 
 		 215 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  57.92 
 
 		 211 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  59.2 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  59.2 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  55.94 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  56.44 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.85 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  57.29 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.61 
 
 		 214 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  55.77 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  58.71 
 
 		 214 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  55.77 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  55.29 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  55.77 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  57.71 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  55.77 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  60.19 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  56.72 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  58.71 
 
 		 214 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  54.98 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  58.71 
 
 		 214 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  61.03 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  55.29 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  55.71 
 
 		 212 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  57.71 
 
 		 214 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  55.24 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  57.43 
 
 		 213 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  55.24 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  57.43 
 
 		 213 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  57.43 
 
 		 213 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  54.84 
 
 		 335 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>