More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0166 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0166  endonuclease III  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  99.6 
 
 
260 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  90.76 
 
 
249 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  73.36 
 
 
254 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  73.91 
 
 
268 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  75.78 
 
 
236 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  67.86 
 
 
260 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  71.43 
 
 
260 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  70.13 
 
 
261 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  74.16 
 
 
258 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  70.14 
 
 
254 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  72.25 
 
 
274 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  66.07 
 
 
252 aa  314  8e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  72.25 
 
 
256 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  65.24 
 
 
252 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  71.29 
 
 
262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  61.28 
 
 
252 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  67.14 
 
 
214 aa  291  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  69.27 
 
 
237 aa  289  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  66.19 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  68.63 
 
 
214 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  67.16 
 
 
240 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  66.18 
 
 
214 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  65.2 
 
 
287 aa  277  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  67.16 
 
 
214 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  66.18 
 
 
247 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  66.67 
 
 
214 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  65.22 
 
 
248 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  63.01 
 
 
230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  62.44 
 
 
210 aa  273  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  64.59 
 
 
359 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.38 
 
 
231 aa  271  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  64.08 
 
 
222 aa  271  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  62.25 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  63.29 
 
 
249 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.25 
 
 
210 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  61.03 
 
 
219 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.03 
 
 
219 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  58.9 
 
 
233 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.81 
 
 
229 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  61.06 
 
 
214 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  62.69 
 
 
214 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  59.9 
 
 
212 aa  263  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  61.27 
 
 
212 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  59.63 
 
 
228 aa  262  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  60.09 
 
 
228 aa  262  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.81 
 
 
219 aa  261  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.98 
 
 
214 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  62.25 
 
 
212 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  59.61 
 
 
211 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  60.09 
 
 
233 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  61.27 
 
 
212 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  61.27 
 
 
212 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  57.89 
 
 
236 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  61.69 
 
 
214 aa  258  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  60.09 
 
 
233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  59.62 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  59.11 
 
 
211 aa  258  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.69 
 
 
214 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  60.7 
 
 
214 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  60.7 
 
 
214 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  61.58 
 
 
214 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  60.7 
 
 
214 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  62.5 
 
 
213 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.7 
 
 
214 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.78 
 
 
212 aa  255  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.71 
 
 
216 aa  255  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  60.7 
 
 
214 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  60.7 
 
 
214 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  60.19 
 
 
213 aa  255  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  59.71 
 
 
216 aa  254  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  61.08 
 
 
214 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  60.29 
 
 
212 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.78 
 
 
212 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  60 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  61.69 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  61.69 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  59.52 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.78 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  57.71 
 
 
235 aa  252  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  60.78 
 
 
335 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  60.19 
 
 
213 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  58.91 
 
 
215 aa  251  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.9 
 
 
211 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  58.65 
 
 
214 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  57.07 
 
 
218 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  57.07 
 
 
218 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  58.54 
 
 
212 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  60.89 
 
 
225 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  60.2 
 
 
222 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  58.21 
 
 
212 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.2 
 
 
212 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>