More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2745 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  80.86 
 
 		 231 aa  367  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  77.03 
 
 		 218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  71.29 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  66.82 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  65.57 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  64.45 
 
 		 215 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  66.03 
 
 		 210 aa  287  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  66.82 
 
 		 213 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  65.07 
 
 		 236 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  65.85 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  63.51 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  63.51 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  63.38 
 
 		 214 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  62.26 
 
 		 214 aa  277  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  63.51 
 
 		 214 aa  277  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  63.03 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.79 
 
 		 214 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  63.03 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  63.03 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  63.03 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  63.03 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  63.03 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  63.03 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  63.11 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  63.21 
 
 		 215 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  62.62 
 
 		 214 aa  274  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  65.05 
 
 		 249 aa  274  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  62.56 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  64.56 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  65.85 
 
 		 214 aa  272  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  59.91 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  64.25 
 
 		 229 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  65.22 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  60.85 
 
 		 214 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  64.08 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  63.43 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  62.09 
 
 		 214 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.85 
 
 		 216 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  62.98 
 
 		 249 aa  270  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  62.25 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.85 
 
 		 212 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  60.85 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  62.25 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  60.85 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.85 
 
 		 214 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  60.38 
 
 		 216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  61.61 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.43 
 
 		 212 aa  267  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  64.39 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2079  endonuclease III  59.91 
 
 		 214 aa  266  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  58.49 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  64.39 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  63.77 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  62.98 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  63.9 
 
 		 268 aa  264  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  62.19 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  58.37 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  63.77 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  61.72 
 
 		 213 aa  261  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  59.52 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.81 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  59.52 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  60.29 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  61.54 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  62.44 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  59.81 
 
 		 213 aa  258  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  61.54 
 
 		 270 aa  258  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  59.62 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  62.38 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  59.81 
 
 		 212 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  58.57 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  61.84 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.8 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.02 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  61.54 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  61.65 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  61.39 
 
 		 260 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.62 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  58.37 
 
 		 212 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  57.89 
 
 		 211 aa  254  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.1 
 
 		 212 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  58.62 
 
 		 212 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  57.62 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  59.42 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  57.49 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  59.13 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  56.56 
 
 		 236 aa  252  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  58.13 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  58.57 
 
 		 335 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  60.19 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.89 
 
 		 211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  59.91 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>