More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2991 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  67.94 
 
 		 218 aa  301  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  64.32 
 
 		 214 aa  297  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  63.85 
 
 		 214 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  66.98 
 
 		 214 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  71.43 
 
 		 237 aa  295  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  68.14 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  70.79 
 
 		 214 aa  295  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  62.5 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  64.79 
 
 		 214 aa  295  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  63.26 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  63.84 
 
 		 261 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  65.09 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  65.09 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  65.09 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  65.09 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  65.09 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  65.09 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  64.22 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  65.09 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  65.57 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  64.79 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  64.79 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  63.38 
 
 		 214 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  64.62 
 
 		 214 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  63.38 
 
 		 214 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  62.95 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.62 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  63.38 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  63.38 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.44 
 
 		 214 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  63.38 
 
 		 214 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  61.64 
 
 		 231 aa  282  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  61.67 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  66.34 
 
 		 274 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.74 
 
 		 214 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  61.97 
 
 		 214 aa  281  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  64.11 
 
 		 210 aa  278  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  60.43 
 
 		 254 aa  277  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  61.86 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  65.37 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  64.25 
 
 		 215 aa  274  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  62.98 
 
 		 260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  59.81 
 
 		 213 aa  272  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  63.68 
 
 		 213 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  61.11 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  60.91 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  60 
 
 		 228 aa  271  9e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  59.55 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  60.38 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  62.2 
 
 		 212 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  61.06 
 
 		 212 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  57.64 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  59.36 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  61.72 
 
 		 212 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  60.19 
 
 		 211 aa  267  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  58.9 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  61.69 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  60.49 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  62.15 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.29 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  60.27 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  60.77 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  58.37 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  63.29 
 
 		 359 aa  265  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.33 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  59.43 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  59.13 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  59.33 
 
 		 213 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.81 
 
 		 229 aa  264  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  60.29 
 
 		 213 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.75 
 
 		 212 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  58.65 
 
 		 211 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  58.65 
 
 		 211 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  59.24 
 
 		 211 aa  263  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  60.1 
 
 		 260 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  60.19 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  58.65 
 
 		 211 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  58.17 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  58.65 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  59.74 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.17 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.38 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  58.17 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  60.77 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  60.19 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  61.35 
 
 		 216 aa  262  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.42 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  57.89 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  58.56 
 
 		 335 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  61.43 
 
 		 213 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  58.74 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.61 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  62.25 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  57.69 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  57.69 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  57.69 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  57.69 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  57.69 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  57.69 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>