More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1172 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  60 
 
 		 214 aa  275  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  51.85 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  51.85 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  51.85 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  51.85 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  51.85 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  51.85 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  51.39 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  53.02 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  51.85 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  50.93 
 
 		 215 aa  226  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  50.93 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  50.7 
 
 		 223 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  54.15 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  50 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  49.77 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  50.7 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  50.7 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  51.22 
 
 		 237 aa  214  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.89 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1026  EndoIII-related endonuclease  52.31 
 
 		 209 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.744613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  49.76 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  49.28 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  52.74 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  46.89 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  47.06 
 
 		 220 aa  194  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  48.6 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  45.54 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  49.51 
 
 		 233 aa  192  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  48.99 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  47.17 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  47.32 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  44.83 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  49.49 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.6 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.7 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  45.75 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  49.49 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.49 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  47.96 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  45.28 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  44.44 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  49.23 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  44.71 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  43.4 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.83 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  46.12 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  44.81 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  46.5 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  44.81 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  46.12 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  45.58 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  46.01 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  45.24 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  43.93 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  44.29 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  44.81 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.98 
 
 		 268 aa  185  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  48.22 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.12 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  48.31 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.22 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  45.28 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  44.34 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  45.28 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.07 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.45 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.79 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  45.45 
 
 		 236 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  47.98 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  45.28 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.66 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  44.34 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  44.81 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  48.57 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  46.19 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  44.34 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.29 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  47.5 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  49.23 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  44.34 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  44.34 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  44.34 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  47.37 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  44.34 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.45 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  44.34 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  47.96 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  44.34 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  44.34 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>