More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1990 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  73.11 
 
 		 216 aa  322  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  71.23 
 
 		 212 aa  317  9e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  67.45 
 
 		 212 aa  307  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  70 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  69.27 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  64.62 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.28 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  50.49 
 
 		 256 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.69 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  49.51 
 
 		 213 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  50.25 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  50.25 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  49.75 
 
 		 258 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  52.08 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.08 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  49.5 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  48.96 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  49.01 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  49.01 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  49.25 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  48.82 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  48.44 
 
 		 211 aa  204  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  48.74 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  48.96 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  47.39 
 
 		 260 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  47.47 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  49.48 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  47.47 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  49.48 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  48.44 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  48.51 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 210 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.55 
 
 		 211 aa  201  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  46.88 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  49.24 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  47.64 
 
 		 212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  46.88 
 
 		 212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  50 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.76 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  46.35 
 
 		 212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  48.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  48.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  48.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  48.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  48.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.51 
 
 		 268 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  48.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  48.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  47.12 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  48.17 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  46.88 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.45 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  46.88 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  48.69 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  48.73 
 
 		 213 aa  197  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  46.88 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  47.69 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  48.96 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.48 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  47.92 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  48.26 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  48.96 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  46.5 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  46.12 
 
 		 213 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  46.12 
 
 		 213 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  48.73 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.12 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  46.08 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.27 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  45.63 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  47.4 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.88 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  47.26 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  45.63 
 
 		 213 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  44.17 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  47.76 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  46.35 
 
 		 335 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  47.21 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.63 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  46 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  45.63 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.64 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  46.19 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  47.4 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  46.88 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  46.38 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  47.26 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  46.6 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  47 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  47 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  47 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  47 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  46.27 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  47 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  47.92 
 
 		 240 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  47 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  46.77 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>