More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2109 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  100 
 
 		 223 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  87.89 
 
 		 223 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  83.26 
 
 		 215 aa  383  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  83.26 
 
 		 215 aa  383  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  83.26 
 
 		 215 aa  383  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  83.26 
 
 		 215 aa  383  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  83.26 
 
 		 215 aa  383  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  83.26 
 
 		 215 aa  383  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  81.86 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  81.4 
 
 		 215 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  80.47 
 
 		 215 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  80.93 
 
 		 215 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  80 
 
 		 215 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  62.33 
 
 		 219 aa  291  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  62.44 
 
 		 219 aa  286  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  62.44 
 
 		 219 aa  286  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  54.21 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.02 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  49.04 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  52.38 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.99 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.5 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  50 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  51.74 
 
 		 208 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  49.5 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  49.25 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  49.27 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  50.51 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.23 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  50.24 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  48.44 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  49.01 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  49.74 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  53.93 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.74 
 
 		 258 aa  197  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  47.39 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  48.02 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  50.24 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  50 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.92 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  49.01 
 
 		 210 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  46.73 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  49.51 
 
 		 213 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  48.5 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  48.04 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.04 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.75 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  48.54 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  46.45 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  47.09 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  51.87 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  49.27 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  47.57 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  48.78 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  47.15 
 
 		 235 aa  191  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  48.78 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  47.92 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  50.26 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.85 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  47.09 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  46.83 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  47.2 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  45.62 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  45.81 
 
 		 224 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.04 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  47.4 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  47.55 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  50.26 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.81 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  49.5 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  50 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.88 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  47.06 
 
 		 258 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  48.04 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  47.8 
 
 		 249 aa  187  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.26 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  46.19 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  44.79 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  46.15 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.02 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  46.51 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  47.37 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.74 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  46.57 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  49.74 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  47.06 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  47.85 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  48.48 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  48.72 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  46.19 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  48.29 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  49.74 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.23 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  47.55 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  47.55 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  47.55 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.27 
 
 		 256 aa  184  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  48.7 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.06 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1026  EndoIII-related endonuclease  45.37 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.744613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>