More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0683 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  53.37 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  55.94 
 
 
214 aa  238  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.17 
 
 
218 aa  238  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  53.66 
 
 
225 aa  237  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  50.24 
 
 
228 aa  231  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  54.11 
 
 
235 aa  231  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.43 
 
 
278 aa  230  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.2 
 
 
217 aa  227  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  52.68 
 
 
227 aa  226  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.46 
 
 
223 aa  224  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  52.2 
 
 
227 aa  224  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  50 
 
 
230 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  50.73 
 
 
228 aa  222  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  49.51 
 
 
212 aa  222  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  52.71 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  51.22 
 
 
227 aa  221  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  53.17 
 
 
215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  50.73 
 
 
224 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  50 
 
 
220 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  50 
 
 
220 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  49.52 
 
 
222 aa  214  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  50.49 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  46.83 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  46.83 
 
 
210 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.8 
 
 
219 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.15 
 
 
213 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  48.29 
 
 
234 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  49.25 
 
 
208 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  49.27 
 
 
219 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.38 
 
 
228 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  48.98 
 
 
286 aa  201  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  45.45 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.82 
 
 
258 aa  198  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  46.23 
 
 
215 aa  198  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  45.54 
 
 
285 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  46.86 
 
 
211 aa  197  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  46.15 
 
 
220 aa  197  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  50 
 
 
215 aa  197  7.999999999999999e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  45.27 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  45.15 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  50 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.2 
 
 
226 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  47.06 
 
 
229 aa  193  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  44.12 
 
 
281 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  44.39 
 
 
211 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  48.22 
 
 
212 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  51.1 
 
 
223 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  47.57 
 
 
223 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  48.54 
 
 
215 aa  191  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  48.06 
 
 
215 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  48.06 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  48.06 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  48.06 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  48.06 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  48.54 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  48.06 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  48.06 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  49.03 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  44.93 
 
 
219 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  48.07 
 
 
218 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  42.51 
 
 
216 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  49.73 
 
 
239 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.33 
 
 
178 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  47.06 
 
 
246 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  45.77 
 
 
219 aa  184  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.77 
 
 
219 aa  184  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  45.54 
 
 
209 aa  184  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  45.9 
 
 
284 aa  184  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.66 
 
 
233 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  47.31 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  42.44 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.54 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  43.33 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  49.72 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  43.41 
 
 
207 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.02 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.7 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  45.9 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  45.36 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  45.18 
 
 
215 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  46.99 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  42.05 
 
 
220 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  44.81 
 
 
245 aa  177  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  44.22 
 
 
260 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  46.34 
 
 
218 aa  177  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  42.93 
 
 
226 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  44.17 
 
 
219 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  44.17 
 
 
219 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  45.36 
 
 
276 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  45.9 
 
 
256 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  42.64 
 
 
233 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.36 
 
 
259 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.36 
 
 
259 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  40.38 
 
 
220 aa  174  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  43.9 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  47.25 
 
 
219 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  42.71 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  42.36 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  44.81 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>