More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1525 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  97.61 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  57.65 
 
 		 208 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  57.64 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  52.24 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  50.97 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.25 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  50.5 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  50.5 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  49.01 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  49.25 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.3 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.33 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  50 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  45.05 
 
 		 238 aa  207  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  47.76 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  48.51 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  50.52 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  45.77 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.39 
 
 		 258 aa  205  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  48.21 
 
 		 246 aa  205  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  48.02 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  48.02 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  45.41 
 
 		 215 aa  204  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  47.42 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  46.53 
 
 		 228 aa  204  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  51.44 
 
 		 219 aa  204  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  48.26 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  45.54 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.28 
 
 		 218 aa  204  9e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  48.77 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  47.72 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  47.52 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  49.01 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  46.88 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  49.25 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  47.74 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.34 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  48.21 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  48.76 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  47.24 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.93 
 
 		 277 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  44.06 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.83 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  51.3 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  49.75 
 
 		 211 aa  197  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  44.1 
 
 		 268 aa  197  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  47.52 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  45.05 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  47.06 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  43.96 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.53 
 
 		 212 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  48.5 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  47.74 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  45.31 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  49.75 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.46 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  45.41 
 
 		 218 aa  195  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  44.28 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  44.33 
 
 		 284 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  49.75 
 
 		 212 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  47.26 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  44.55 
 
 		 227 aa  194  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  50.51 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  47.47 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  46.73 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  44.95 
 
 		 276 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.93 
 
 		 241 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  45.88 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  45.45 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  45.45 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  46.73 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  46.38 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  49.75 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  48 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  48.51 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.51 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.78 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  46.8 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  46.5 
 
 		 286 aa  192  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  46.53 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.74 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  48.51 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  46.19 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.29 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  44.83 
 
 		 233 aa  191  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  50 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  48.29 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  47.52 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  49.49 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  44.74 
 
 		 276 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  47.78 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  47.52 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>