More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0470 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  75.7 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  65.85 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  59.7 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.15 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  51.83 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  51.72 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  50.5 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.76 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  49.29 
 
 		 291 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  49.55 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  51.79 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  49.01 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  50 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  46.76 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.53 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  47.29 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  47.29 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  47.29 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  47.29 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  47.29 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  47.29 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  49.02 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  45.05 
 
 		 214 aa  198  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  49.01 
 
 		 223 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  50 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  45.27 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  46.45 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  50.5 
 
 		 218 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  46.8 
 
 		 215 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  46.64 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  48.47 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  49.51 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  50.99 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  49.25 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  50 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  44.55 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  44.28 
 
 		 209 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  49.51 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  48.29 
 
 		 281 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.75 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  47.76 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.5 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  49.74 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  45.05 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  45.05 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  47.34 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  48.37 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  51.61 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.89 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  46.31 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  51.22 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  51.22 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  51.22 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  51.22 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  48.51 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  51.22 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  51.22 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  51.22 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  46.57 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  46.57 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  51.22 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  48.47 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  48.84 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  50.73 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  47.55 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  50.99 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  52.15 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  45.32 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  51.61 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  43.65 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  45.32 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  53.23 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.23 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 211 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  49.75 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  49.5 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.27 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  50.5 
 
 		 211 aa  188  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  49.5 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  49.01 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.17 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  49.76 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  52.04 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  49.27 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.87 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  49.76 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  49.76 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.87 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  46.77 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  47.39 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>