More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0436 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  57.64 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  54.87 
 
 
208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  53.43 
 
 
211 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  53.23 
 
 
209 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.54 
 
 
258 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  52.24 
 
 
209 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.35 
 
 
241 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  49.04 
 
 
223 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  52.5 
 
 
238 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  48.11 
 
 
215 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  52.88 
 
 
248 aa  214  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  47.12 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  52.82 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  52.55 
 
 
222 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.85 
 
 
263 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  49.02 
 
 
218 aa  210  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  46.23 
 
 
215 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  46.23 
 
 
215 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  46.23 
 
 
215 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  46.23 
 
 
215 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  46.23 
 
 
215 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  46.23 
 
 
215 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.25 
 
 
278 aa  210  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  47.14 
 
 
218 aa  209  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  46.86 
 
 
216 aa  209  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.57 
 
 
214 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  48.77 
 
 
227 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  51.31 
 
 
246 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  46.31 
 
 
212 aa  208  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  47.55 
 
 
211 aa  208  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.96 
 
 
233 aa  208  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  45.28 
 
 
215 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  47.55 
 
 
211 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  49.51 
 
 
215 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.1 
 
 
218 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  51.02 
 
 
217 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  50.27 
 
 
220 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  49.25 
 
 
237 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  53.12 
 
 
197 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  46.6 
 
 
220 aa  205  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  45.28 
 
 
215 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  51.34 
 
 
225 aa  204  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  46.77 
 
 
207 aa  204  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  48.74 
 
 
225 aa  204  8e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.63 
 
 
213 aa  204  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  49.76 
 
 
216 aa  204  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  51.03 
 
 
234 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  52 
 
 
228 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  47.03 
 
 
215 aa  202  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  43.9 
 
 
219 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  43.9 
 
 
219 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  50 
 
 
256 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  46.31 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  48.31 
 
 
219 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  45.28 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  42.59 
 
 
219 aa  201  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  48.28 
 
 
235 aa  201  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  48.98 
 
 
212 aa  201  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  50 
 
 
215 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  48.98 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  48.08 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  45.75 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  51 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  48.98 
 
 
291 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.02 
 
 
223 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  46.57 
 
 
215 aa  199  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  51.79 
 
 
233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  48.76 
 
 
226 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  46.15 
 
 
210 aa  197  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  45.71 
 
 
224 aa  197  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  49.24 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  46.48 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  48.17 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  45.1 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.98 
 
 
277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  47.06 
 
 
233 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.24 
 
 
243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  49.21 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  45.93 
 
 
227 aa  194  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  46.89 
 
 
248 aa  194  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  43.78 
 
 
210 aa  194  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  49.74 
 
 
259 aa  194  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  45.73 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  51.06 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  47.76 
 
 
235 aa  194  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  47.64 
 
 
276 aa  193  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  49.49 
 
 
214 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.12 
 
 
211 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  49.49 
 
 
214 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  50.25 
 
 
224 aa  192  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  48.98 
 
 
256 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  46.19 
 
 
286 aa  193  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  49.74 
 
 
245 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.61 
 
 
217 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  48.47 
 
 
212 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  47.96 
 
 
212 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  48.34 
 
 
218 aa  192  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.74 
 
 
218 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.31 
 
 
212 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>