More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0091 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  100 
 
 
237 aa  486  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  75.7 
 
 
235 aa  335  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  64.39 
 
 
233 aa  254  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  54.37 
 
 
217 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.22 
 
 
277 aa  228  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  52.61 
 
 
291 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  56.93 
 
 
268 aa  224  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.61 
 
 
258 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  53.69 
 
 
246 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  53.11 
 
 
238 aa  214  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.22 
 
 
218 aa  214  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  51.89 
 
 
256 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  52.82 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  53.37 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  53.33 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  50.24 
 
 
227 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  52.02 
 
 
216 aa  211  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.44 
 
 
243 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  48.34 
 
 
251 aa  207  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  48.8 
 
 
286 aa  207  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  49.25 
 
 
220 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  45.77 
 
 
209 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.45 
 
 
219 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  52.74 
 
 
239 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  50.72 
 
 
212 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  45.77 
 
 
209 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.24 
 
 
241 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  51.44 
 
 
234 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  49.5 
 
 
223 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  48.58 
 
 
233 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  51.64 
 
 
228 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  48.56 
 
 
221 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  50.75 
 
 
246 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  49.26 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  50.26 
 
 
276 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 
263 aa  198  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  49.03 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.26 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  52.69 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  48.02 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  52.69 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  48.82 
 
 
230 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  44.55 
 
 
214 aa  194  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.38 
 
 
226 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  47.32 
 
 
281 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  52.04 
 
 
259 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  47.06 
 
 
225 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  45.81 
 
 
215 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  45.81 
 
 
215 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  45.81 
 
 
215 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  45.81 
 
 
215 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  44.02 
 
 
254 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  45.81 
 
 
215 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.76 
 
 
233 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  45.81 
 
 
215 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  47.37 
 
 
226 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  48.28 
 
 
213 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  50.51 
 
 
245 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  50.26 
 
 
276 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  47.03 
 
 
215 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  47.6 
 
 
230 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  48.51 
 
 
236 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  49.76 
 
 
216 aa  192  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  46.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  46.6 
 
 
220 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  47.06 
 
 
220 aa  191  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.89 
 
 
259 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.89 
 
 
259 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  45.32 
 
 
215 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  48.56 
 
 
284 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.6 
 
 
213 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  45.54 
 
 
224 aa  191  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  51.61 
 
 
249 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  47.12 
 
 
230 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.45 
 
 
259 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  47.44 
 
 
256 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  47.91 
 
 
228 aa  190  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  46.83 
 
 
212 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.4 
 
 
226 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49 
 
 
214 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  46.08 
 
 
215 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  48.37 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  50.25 
 
 
213 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  44.06 
 
 
225 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  46.83 
 
 
211 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.6 
 
 
210 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  45.05 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  45.05 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  49.02 
 
 
214 aa  188  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  45.66 
 
 
248 aa  188  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  45.87 
 
 
260 aa  187  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  44.12 
 
 
213 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  49.51 
 
 
214 aa  187  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  44.55 
 
 
219 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  43.56 
 
 
218 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  46.83 
 
 
211 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  45.59 
 
 
215 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.55 
 
 
218 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  46.15 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  48.72 
 
 
270 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>