More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8862 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  61.51 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  63.04 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.43 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  67.61 
 
 
234 aa  305  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  66.97 
 
 
238 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  62.11 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  61.04 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  61.04 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  61.28 
 
 
260 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  63.64 
 
 
246 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.64 
 
 
259 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.3 
 
 
243 aa  300  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  60.25 
 
 
258 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  61.89 
 
 
246 aa  298  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  64.84 
 
 
268 aa  297  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.67 
 
 
258 aa  295  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  63.48 
 
 
256 aa  294  8e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  64.19 
 
 
248 aa  293  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.53 
 
 
241 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  64.81 
 
 
257 aa  292  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  63.56 
 
 
245 aa  287  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  65.74 
 
 
259 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  61.9 
 
 
276 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  60.56 
 
 
244 aa  284  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  62.03 
 
 
239 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  63.16 
 
 
276 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.5 
 
 
263 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  60.89 
 
 
228 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  66.51 
 
 
245 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  61.24 
 
 
270 aa  272  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  58.12 
 
 
284 aa  264  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  59.22 
 
 
241 aa  254  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  54.55 
 
 
216 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.19 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  52.22 
 
 
225 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  50.95 
 
 
221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  52.8 
 
 
234 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  51.21 
 
 
220 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  51.21 
 
 
220 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.71 
 
 
218 aa  215  5e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  51.72 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  49.07 
 
 
228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.56 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  49.28 
 
 
210 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  52.22 
 
 
230 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  47.91 
 
 
286 aa  211  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.25 
 
 
223 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  50.25 
 
 
227 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  48.37 
 
 
220 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.74 
 
 
214 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  47.57 
 
 
217 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  46.7 
 
 
224 aa  208  7e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  48.34 
 
 
237 aa  207  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  47.8 
 
 
215 aa  207  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48 
 
 
278 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  49.75 
 
 
224 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4289  putative endonuclease III  57.14 
 
 
178 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  47.96 
 
 
233 aa  205  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  45.33 
 
 
281 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  45.71 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  48.26 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.74 
 
 
228 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  45.54 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  47.52 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  44.61 
 
 
208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  46.45 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  45.05 
 
 
209 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  46.46 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  44.93 
 
 
212 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  45 
 
 
210 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  42.93 
 
 
209 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  47.06 
 
 
226 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  46.48 
 
 
222 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  44.88 
 
 
220 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.74 
 
 
219 aa  191  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  45.45 
 
 
216 aa  191  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  45.6 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  46.76 
 
 
230 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  45.83 
 
 
230 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.59 
 
 
226 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  45.31 
 
 
215 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  46.34 
 
 
219 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  46.77 
 
 
211 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  44.5 
 
 
218 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.08 
 
 
216 aa  185  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  44.27 
 
 
215 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  44.95 
 
 
213 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  42.79 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  44.79 
 
 
215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  49.17 
 
 
215 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  46.27 
 
 
212 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  41.4 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>