More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1540 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  87.21 
 
 
219 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  65.89 
 
 
215 aa  300  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  65.89 
 
 
215 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  65.89 
 
 
215 aa  300  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  65.89 
 
 
215 aa  300  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  65.89 
 
 
215 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  65.89 
 
 
215 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  65.89 
 
 
215 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  65.42 
 
 
215 aa  298  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  65.42 
 
 
215 aa  296  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  64.49 
 
 
215 aa  292  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  64.02 
 
 
215 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  63.38 
 
 
223 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  62.44 
 
 
223 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.7 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  50 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  51.43 
 
 
213 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  50.5 
 
 
209 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  50.5 
 
 
209 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  48.58 
 
 
218 aa  208  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  43.9 
 
 
220 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  49.75 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  49.74 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  48.02 
 
 
258 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  45.05 
 
 
235 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.51 
 
 
274 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  50 
 
 
260 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  46.89 
 
 
207 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.78 
 
 
211 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  46.77 
 
 
256 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  48.77 
 
 
236 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  46.53 
 
 
254 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  47.52 
 
 
256 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  46.77 
 
 
227 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  47.03 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  44.08 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  44.39 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  46.67 
 
 
212 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  48.45 
 
 
260 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  47.76 
 
 
219 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  45.05 
 
 
237 aa  188  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  48.96 
 
 
236 aa  187  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.5 
 
 
213 aa  187  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  47.45 
 
 
213 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  44.39 
 
 
219 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.39 
 
 
219 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  51.65 
 
 
231 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.92 
 
 
258 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49 
 
 
212 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  45.02 
 
 
210 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  49.73 
 
 
215 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  47.92 
 
 
254 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  47.47 
 
 
214 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  46.94 
 
 
246 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  45.71 
 
 
230 aa  185  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.55 
 
 
231 aa  185  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.15 
 
 
213 aa  185  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  46.04 
 
 
210 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.19 
 
 
211 aa  185  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  48.66 
 
 
214 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  47.32 
 
 
212 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  45.45 
 
 
210 aa  184  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  46.31 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.26 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  42.86 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  46.19 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  47.29 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  50.27 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  46.31 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  48.15 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  48.13 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  46.19 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  47.34 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  46.8 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  47.69 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  48.7 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  46.83 
 
 
212 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  46.27 
 
 
248 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  50.27 
 
 
214 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  43.27 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  45.73 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  46.83 
 
 
212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  45.26 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.55 
 
 
212 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.9 
 
 
214 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.4 
 
 
237 aa  181  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.78 
 
 
214 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.28 
 
 
241 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  48.9 
 
 
214 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.17 
 
 
218 aa  181  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  50.54 
 
 
197 aa  180  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.13 
 
 
210 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  48.4 
 
 
213 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  45.93 
 
 
211 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  45.93 
 
 
211 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  44.33 
 
 
214 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  45.93 
 
 
211 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  45.93 
 
 
211 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>