More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0761 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  100 
 
 
197 aa  412  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  57.14 
 
 
212 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  57.45 
 
 
208 aa  228  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  58.85 
 
 
213 aa  224  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  53.12 
 
 
220 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  50.52 
 
 
209 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  52.82 
 
 
218 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  50.52 
 
 
209 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  48.68 
 
 
207 aa  204  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  53.85 
 
 
214 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.96 
 
 
258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  53.16 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  53.3 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  53.16 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  53.16 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  53.16 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  53.16 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  53.16 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  53.3 
 
 
214 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  53.16 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  53.3 
 
 
214 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  53.93 
 
 
223 aa  197  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  53.3 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.3 
 
 
214 aa  197  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  197  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  52.63 
 
 
215 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.73 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  50.26 
 
 
227 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  52.11 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  52.2 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  52.2 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  53.3 
 
 
214 aa  195  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  51.05 
 
 
212 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  52.11 
 
 
219 aa  194  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  52.11 
 
 
215 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  51.32 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  52.11 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  51.58 
 
 
215 aa  194  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  52.75 
 
 
214 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.2 
 
 
214 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  50.55 
 
 
211 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  50.53 
 
 
212 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  49.47 
 
 
212 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.53 
 
 
233 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  49.47 
 
 
212 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 
212 aa  191  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 
214 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  51.65 
 
 
214 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  49.47 
 
 
211 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.45 
 
 
214 aa  190  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  50.26 
 
 
219 aa  190  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.26 
 
 
219 aa  190  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  51.65 
 
 
214 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  47.69 
 
 
215 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  51.06 
 
 
219 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  50 
 
 
211 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  48.45 
 
 
214 aa  190  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  47.87 
 
 
212 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  50.55 
 
 
211 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  50.55 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  49.47 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  48.11 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  47.87 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.47 
 
 
223 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  50 
 
 
211 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  50 
 
 
211 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  50 
 
 
211 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  50 
 
 
211 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  50 
 
 
211 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  49.47 
 
 
211 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  46.91 
 
 
210 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  47.87 
 
 
212 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  49.45 
 
 
212 aa  187  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  51.1 
 
 
213 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  47.87 
 
 
215 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  50 
 
 
224 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  50 
 
 
213 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  45.7 
 
 
225 aa  186  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  50 
 
 
211 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  47.87 
 
 
335 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.8 
 
 
212 aa  186  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  46.03 
 
 
216 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.21 
 
 
214 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  47.89 
 
 
220 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.1 
 
 
211 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  47.31 
 
 
226 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>