More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2331 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  100 
 
 		 211 aa  440  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  60 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  53.43 
 
 		 220 aa  231  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  53.03 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  53.23 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  53.54 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  55.1 
 
 		 212 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  53.06 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  53.57 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  53.06 
 
 		 211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  53.06 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  50.98 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  53.06 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  53.06 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  53.06 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  53 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  50.25 
 
 		 217 aa  214  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  54.08 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  50.73 
 
 		 212 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  52.55 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  54.08 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.73 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.73 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  52.28 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.53 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  53.23 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  52.04 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  53.23 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  53.3 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  51.27 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  53.23 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  52.55 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  53.23 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.23 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  52.04 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.26 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  52.04 
 
 		 213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  53.23 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  52.55 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  50.76 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  52.55 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.55 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  53.06 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  49.51 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  53.06 
 
 		 212 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  51.53 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  50.76 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  50 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  52.02 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  50.75 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  52.31 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  50.75 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  50.5 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  52.02 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  52 
 
 		 254 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  51.28 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  51.28 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  52.24 
 
 		 215 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  51.28 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  51.27 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.04 
 
 		 212 aa  207  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  51 
 
 		 214 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.25 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  52.04 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  51.79 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  51.79 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  51.24 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  49.52 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  47.8 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  52.55 
 
 		 335 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  52.28 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  51.53 
 
 		 213 aa  204  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  50.51 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  50.51 
 
 		 213 aa  204  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.78 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  51.78 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  50.25 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  51.78 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  51.78 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  49.5 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  50.76 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>