More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3269 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  77.21 
 
 
223 aa  352  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  72.81 
 
 
230 aa  345  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  73.27 
 
 
220 aa  341  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  73.27 
 
 
220 aa  341  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  75.12 
 
 
224 aa  336  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  71.96 
 
 
221 aa  332  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  67.32 
 
 
228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  54.68 
 
 
225 aa  250  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  52.94 
 
 
218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  56.63 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.94 
 
 
218 aa  239  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  51.23 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  57.22 
 
 
219 aa  231  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  55.21 
 
 
213 aa  231  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.94 
 
 
258 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  52.2 
 
 
210 aa  227  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.27 
 
 
214 aa  226  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  49.76 
 
 
217 aa  224  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  47.51 
 
 
238 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  51.22 
 
 
285 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 
226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  50.72 
 
 
234 aa  221  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  50.98 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  50.76 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.24 
 
 
278 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  53.65 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  52.58 
 
 
222 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  48.78 
 
 
227 aa  217  8.999999999999998e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  52.28 
 
 
246 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  50.52 
 
 
276 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  51.79 
 
 
234 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  48.29 
 
 
227 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  45.89 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  51.76 
 
 
286 aa  215  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  50.25 
 
 
228 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  49.51 
 
 
284 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  54.12 
 
 
239 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 
241 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  51 
 
 
216 aa  214  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  46.34 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  51.04 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  47.8 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  48.77 
 
 
246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  48.56 
 
 
251 aa  212  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.97 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  52.06 
 
 
268 aa  211  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.61 
 
 
263 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  51.24 
 
 
281 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  48.29 
 
 
215 aa  209  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  52.11 
 
 
257 aa  208  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  49.51 
 
 
216 aa  207  9e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  49.74 
 
 
248 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  52.06 
 
 
245 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  50.26 
 
 
256 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  49.21 
 
 
276 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  51.58 
 
 
256 aa  204  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  48.04 
 
 
215 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  49.75 
 
 
230 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  49.75 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.33 
 
 
243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  47.55 
 
 
229 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  47.94 
 
 
270 aa  198  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  50.24 
 
 
228 aa  197  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  48.97 
 
 
245 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.91 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  45.45 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  48.97 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  44.93 
 
 
291 aa  194  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.94 
 
 
259 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  48.28 
 
 
219 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.94 
 
 
259 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  44.61 
 
 
220 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.94 
 
 
259 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  48.45 
 
 
258 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  45.85 
 
 
223 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  45.85 
 
 
223 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.77 
 
 
226 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  47.42 
 
 
260 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.6 
 
 
218 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  45.89 
 
 
218 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  46.34 
 
 
233 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  48.97 
 
 
259 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  47.94 
 
 
224 aa  189  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  44.33 
 
 
215 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  41.46 
 
 
223 aa  187  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  42.38 
 
 
220 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  46.11 
 
 
215 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  46.23 
 
 
208 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  45.05 
 
 
209 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  45.05 
 
 
209 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  43.41 
 
 
237 aa  185  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  45.59 
 
 
226 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  47.37 
 
 
197 aa  184  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  47.8 
 
 
214 aa  184  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  46.11 
 
 
215 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  46.11 
 
 
215 aa  184  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  46.11 
 
 
215 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  46.11 
 
 
215 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  46.11 
 
 
215 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>