More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3611 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  95.52 
 
 		 230 aa  423  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  95.96 
 
 		 230 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  82.24 
 
 		 226 aa  355  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  50.46 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  50.23 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  51.43 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  50 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  50 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.77 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  46.4 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.75 
 
 		 223 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  48.8 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  47.78 
 
 		 218 aa  195  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  47.26 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  50.25 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  46.45 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.74 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  45.83 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.39 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.76 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  49.03 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  46.27 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  44.76 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  46.51 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  47.42 
 
 		 224 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.19 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  46.77 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  44.7 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  45.37 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  50 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.85 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  47.66 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  45.85 
 
 		 228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  44.55 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  47.37 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  43.48 
 
 		 208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  43.86 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  46.19 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  45.32 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  39.9 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  40.8 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  45 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  40.61 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  42.08 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  40.8 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  43.52 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  48.62 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  49.74 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.13 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.5 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  42.35 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  47.52 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  48.72 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  44.98 
 
 		 281 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  42.59 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  44.5 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.29 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  43.78 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  42.36 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  51.31 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  46.83 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  51.93 
 
 		 267 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.83 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  44.19 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.52 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  45.59 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  42.79 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.41 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  41.95 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.88 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  44.55 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  43.26 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.75 
 
 		 268 aa  168  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  42.93 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  46.08 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  45.45 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  46.63 
 
 		 249 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  42.92 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  44.68 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  43.87 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  43.52 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.23 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.98 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  41.47 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  43.4 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.5 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.47 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  44.04 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  47.45 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  45.55 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.07 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  43.55 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.59 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  46.5 
 
 		 239 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.8 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.26 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.48 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  43.22 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0246  endonuclease III  38.14 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00760265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>