More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1491 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 226 aa  466  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  70.85 
 
 		 281 aa  329  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  69.2 
 
 		 285 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  68.32 
 
 		 228 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  60 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  56.87 
 
 		 222 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  51.96 
 
 		 230 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  51.47 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  51.47 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.56 
 
 		 228 aa  228  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.2 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 		 217 aa  221  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  52.4 
 
 		 224 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  47.17 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  51.96 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  48.28 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.29 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  48.79 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  46.6 
 
 		 286 aa  209  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  43.84 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.8 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  45.32 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  45.24 
 
 		 215 aa  204  8e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  47.37 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.24 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  46.67 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  47.85 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  46.89 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  46.77 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.48 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.77 
 
 		 278 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.29 
 
 		 263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  43.9 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  46.38 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  43.2 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  47.55 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  42.44 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  44.44 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  45.89 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  47.42 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  46.67 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  45.59 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  42.65 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  46.23 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  47.42 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  45.59 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.19 
 
 		 256 aa  187  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  46.46 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  46.19 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  45.93 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  42.59 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  43.94 
 
 		 276 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  40.91 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  43.07 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  40.18 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  42.49 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  43.07 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.12 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  47.83 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.12 
 
 		 244 aa  181  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  43.5 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  42.86 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  41.5 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.05 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  44.93 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  45.63 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  42.08 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.92 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  40.78 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  44.93 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  45.15 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  44.34 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  42.03 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.09 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  45.07 
 
 		 259 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  44.9 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  40.98 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  46.41 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  40.18 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  39.61 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  42.11 
 
 		 284 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  44.5 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  44.02 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  41.75 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  41.23 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  42.03 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  47.4 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  44.39 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  42.11 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.03 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  43.96 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  44.67 
 
 		 245 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  38.61 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.5 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  40.48 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  44.9 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  41.43 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  44.67 
 
 		 260 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  40.47 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>