More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1289 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  100 
 
 		 220 aa  457  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  65.75 
 
 		 222 aa  300  9e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  65.07 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  50.46 
 
 		 223 aa  231  8.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  48.37 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  49.76 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  47.6 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  47.14 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.12 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  48.78 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  48.79 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.6 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  45 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  47.6 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.67 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  47.57 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  44.17 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  45.45 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  48.24 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  47 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.38 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  45.5 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  47.22 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  46.41 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  45.02 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  45.02 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  41.31 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  47.34 
 
 		 281 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  45.62 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  44.65 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.87 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  47.8 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  46.7 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.24 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  43.2 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.11 
 
 		 278 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  46.83 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  46.01 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  43.6 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  45.85 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  47.18 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.2 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  47.18 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.32 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  44.39 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  46.67 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  46.67 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  46.67 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  46.15 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  46.67 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  46.57 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  44.24 
 
 		 286 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  46.67 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  46.67 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  47.76 
 
 		 246 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  46.67 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  45.83 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  42.31 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  47.83 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  40.38 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  45.1 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  44.66 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  44.71 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  45.64 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  44.64 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  50.79 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  45.55 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  42.79 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  43.9 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  45.37 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  48.98 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  42.79 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.65 
 
 		 241 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 		 243 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  44.93 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  41.63 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1026  EndoIII-related endonuclease  48.96 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.744613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  43.17 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  44.12 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.9 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  44.23 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.76 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  45.6 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.41 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.9 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.9 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.45 
 
 		 263 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  43.69 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  44.44 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  44.72 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  45.23 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.89 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  43.19 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  45.93 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.33 
 
 		 259 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  47.26 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  45.93 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  41.46 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.26 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  45.67 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>