More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1050 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  100 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  56.72 
 
 
218 aa  228  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.04 
 
 
216 aa  216  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  49.75 
 
 
212 aa  210  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  54.14 
 
 
230 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.04 
 
 
217 aa  204  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  52.17 
 
 
221 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.04 
 
 
219 aa  201  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  50.83 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  50.25 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  51.38 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  50.83 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  46.6 
 
 
285 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  48.98 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.54 
 
 
218 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  46.23 
 
 
210 aa  198  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  49 
 
 
224 aa  197  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  50.54 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  46.89 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  48.4 
 
 
229 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  48.39 
 
 
212 aa  195  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  47.6 
 
 
224 aa  194  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  45.73 
 
 
228 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  49.46 
 
 
218 aa  192  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  46.41 
 
 
215 aa  191  7e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  45.24 
 
 
235 aa  190  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.28 
 
 
277 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  45.7 
 
 
210 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.04 
 
 
278 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.38 
 
 
258 aa  188  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.24 
 
 
214 aa  187  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.99 
 
 
213 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  48.63 
 
 
210 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  50.28 
 
 
276 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  51.38 
 
 
239 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  48.91 
 
 
234 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  48.62 
 
 
216 aa  185  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  43.96 
 
 
281 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  48.62 
 
 
291 aa  184  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  48.13 
 
 
227 aa  184  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  43.32 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  47.8 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.62 
 
 
244 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  49.17 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  50.28 
 
 
246 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  48.24 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.49 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  48.4 
 
 
246 aa  181  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  48.62 
 
 
248 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  43.56 
 
 
223 aa  180  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.5 
 
 
226 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.72 
 
 
228 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.57 
 
 
233 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  45.23 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.07 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  49.17 
 
 
235 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  43.85 
 
 
219 aa  177  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  49.72 
 
 
241 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  43.52 
 
 
220 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  48.62 
 
 
230 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  48.62 
 
 
284 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  43.89 
 
 
218 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  49.19 
 
 
234 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  48.62 
 
 
276 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  40.96 
 
 
215 aa  176  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  48.07 
 
 
230 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  46.38 
 
 
228 aa  175  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  48.51 
 
 
228 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  46.24 
 
 
212 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  47.51 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  46.49 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  45.86 
 
 
227 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.17 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  43.33 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  43.78 
 
 
208 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  46.15 
 
 
286 aa  170  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.62 
 
 
226 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.86 
 
 
243 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.51 
 
 
259 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.51 
 
 
259 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  47.51 
 
 
256 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  45.3 
 
 
227 aa  168  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  43.62 
 
 
213 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  47.51 
 
 
270 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.53 
 
 
218 aa  167  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  41.09 
 
 
211 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  43.72 
 
 
212 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  44.04 
 
 
215 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  43.32 
 
 
211 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.49 
 
 
238 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.96 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  42.31 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  46.41 
 
 
228 aa  165  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  43.17 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  48.07 
 
 
259 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  43.09 
 
 
209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  43.62 
 
 
209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.63 
 
 
218 aa  164  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  45.86 
 
 
226 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>