More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0150 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  53.43 
 
 
220 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  53.43 
 
 
220 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.23 
 
 
278 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  51.96 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.96 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  51.71 
 
 
221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  46.12 
 
 
281 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  51.23 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  46.86 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  47.8 
 
 
228 aa  214  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.03 
 
 
214 aa  213  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  49.75 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  49.03 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.53 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  49.75 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  47.57 
 
 
234 aa  211  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  49.76 
 
 
285 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.89 
 
 
258 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  50.76 
 
 
222 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.2 
 
 
228 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.29 
 
 
217 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  45.71 
 
 
212 aa  208  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  49.25 
 
 
209 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  50.5 
 
 
239 aa  208  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  47.8 
 
 
251 aa  207  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.01 
 
 
218 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  46.89 
 
 
210 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  47.47 
 
 
246 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  47.78 
 
 
235 aa  205  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  48.26 
 
 
227 aa  205  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  49.27 
 
 
219 aa  204  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.24 
 
 
226 aa  204  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.6 
 
 
241 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  45.77 
 
 
234 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.66 
 
 
213 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  47.14 
 
 
222 aa  202  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  44.17 
 
 
286 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  47.92 
 
 
248 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  46.57 
 
 
220 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  50 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  47.92 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.26 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  45.67 
 
 
215 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  45.89 
 
 
229 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  44.02 
 
 
216 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  46.23 
 
 
226 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  46.41 
 
 
215 aa  191  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  45.89 
 
 
223 aa  191  8e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.52 
 
 
277 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  43.2 
 
 
228 aa  190  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  44.78 
 
 
208 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  43.63 
 
 
268 aa  189  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  42.06 
 
 
284 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  47.15 
 
 
276 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  45.23 
 
 
207 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  44.67 
 
 
276 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  43.69 
 
 
213 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  44.72 
 
 
244 aa  187  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  45.41 
 
 
220 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  41.51 
 
 
228 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  46.04 
 
 
209 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  45.54 
 
 
209 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  42.57 
 
 
238 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  41.31 
 
 
220 aa  185  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  40.57 
 
 
227 aa  185  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  42.31 
 
 
246 aa  184  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.14 
 
 
243 aa  184  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  44.55 
 
 
230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  46.88 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  43.14 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  46.6 
 
 
224 aa  182  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  43.48 
 
 
233 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  46.08 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  44.67 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  44.88 
 
 
225 aa  181  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  41.35 
 
 
237 aa  181  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  43.96 
 
 
220 aa  181  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  43.2 
 
 
215 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  43.6 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.89 
 
 
218 aa  181  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.63 
 
 
233 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  43.63 
 
 
248 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  43.41 
 
 
215 aa  180  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  41.43 
 
 
291 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  41.98 
 
 
227 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  40.98 
 
 
256 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  42.65 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.55 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  43.43 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  43.14 
 
 
227 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  42.72 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  45.64 
 
 
216 aa  177  8e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.72 
 
 
216 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  42.16 
 
 
256 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  44.79 
 
 
257 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  42.5 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  46 
 
 
212 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  42.16 
 
 
211 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  43.69 
 
 
223 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>