More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0500 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  100 
 
 		 215 aa  436  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  66.06 
 
 		 219 aa  297  8e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  49.5 
 
 		 286 aa  219  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  53.17 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.51 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  49.02 
 
 		 213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  47.14 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.48 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.08 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.48 
 
 		 278 aa  201  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  43.6 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  43.9 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  43 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  45.67 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  44.88 
 
 		 281 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  44.88 
 
 		 224 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.44 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.28 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  42.38 
 
 		 285 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  43.14 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  43.54 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  41.09 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  43.14 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  43.6 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  40.57 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  42 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.33 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  44.13 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  43.72 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  43.96 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.96 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  42.58 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.59 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  45.63 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  40.57 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  39.62 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  42.79 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  47.85 
 
 		 209 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  44.55 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  46.89 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  42.16 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  43.13 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  44.61 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  43.56 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  41.35 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  45.83 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  40.67 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.59 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.92 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  40.09 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  44.33 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  43.4 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.28 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  41.43 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  43.26 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  46.56 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  42.45 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  39.9 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  46.07 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  42.38 
 
 		 211 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  42.86 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  42.86 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  42.38 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  42.38 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.95 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.9 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  42.38 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.86 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  42.38 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  41.63 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  40.95 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  42.86 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  42.86 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  40.58 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  41.55 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  42.36 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  43 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  43.26 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  45.31 
 
 		 260 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  40.96 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.63 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  42.11 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  42.36 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.38 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  42.38 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  39.71 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  42.38 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  41.43 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.85 
 
 		 178 aa  175  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  42.38 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  42.38 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  42.38 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>