More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1468 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 178 aa  361  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.43 
 
 		 213 aa  221  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  54.02 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.16 
 
 		 214 aa  197  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  50 
 
 		 235 aa  189  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  47.16 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  50 
 
 		 213 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  51.16 
 
 		 225 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  52.33 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 		 223 aa  185  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  47.67 
 
 		 220 aa  184  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  50.86 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.42 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  48.84 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  47.43 
 
 		 209 aa  179  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.32 
 
 		 277 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  47.95 
 
 		 229 aa  178  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  48.84 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  45.14 
 
 		 209 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.09 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  46.51 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  49.72 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  46.24 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.4 
 
 		 259 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  45.14 
 
 		 209 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  48.85 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.1 
 
 		 258 aa  174  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  45.35 
 
 		 217 aa  174  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.4 
 
 		 259 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.4 
 
 		 259 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  45.71 
 
 		 284 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  48.54 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  42.11 
 
 		 238 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  43.68 
 
 		 257 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  44.25 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  45.03 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  45.93 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  46.86 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  42.53 
 
 		 291 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  44.19 
 
 		 276 aa  171  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  42.11 
 
 		 246 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  42.11 
 
 		 234 aa  170  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  43.1 
 
 		 246 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  44.25 
 
 		 256 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  47.67 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  47.67 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  48.85 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  46.51 
 
 		 215 aa  168  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  45.03 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  44.83 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  44.44 
 
 		 251 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  43.18 
 
 		 216 aa  167  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  45.09 
 
 		 260 aa  167  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  45.71 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  46.82 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  46.37 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  45.2 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  44.71 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  41.95 
 
 		 248 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  44.38 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.93 
 
 		 219 aa  164  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.35 
 
 		 278 aa  164  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.86 
 
 		 233 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  40.23 
 
 		 276 aa  164  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  43.27 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  45.98 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  46.51 
 
 		 221 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  42.77 
 
 		 270 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.51 
 
 		 228 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  45.93 
 
 		 234 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  43.75 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  43.18 
 
 		 214 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  44.19 
 
 		 228 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  43.82 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  43.82 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  43.82 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  43.82 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  43.82 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  44.77 
 
 		 286 aa  160  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.38 
 
 		 241 aa  160  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  43.82 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  44.38 
 
 		 215 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  40.34 
 
 		 268 aa  160  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  42.44 
 
 		 228 aa  160  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  44.38 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  41.14 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  43.93 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.51 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0960  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.28 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  43.26 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  44.51 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  39.11 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  48.02 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.02 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  42.7 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  45.98 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  40.91 
 
 		 259 aa  158  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  41.34 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  43.5 
 
 		 227 aa  157  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  42.7 
 
 		 215 aa  157  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>