More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1195 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  65.74 
 
 
224 aa  298  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  55.3 
 
 
260 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  57 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.22 
 
 
241 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  52.61 
 
 
216 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  56 
 
 
245 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  54.73 
 
 
246 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.66 
 
 
258 aa  223  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.39 
 
 
243 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  52.71 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  57.21 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.19 
 
 
263 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.93 
 
 
259 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.93 
 
 
259 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.93 
 
 
259 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  52.24 
 
 
291 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  53.5 
 
 
276 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  55.45 
 
 
256 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  57.21 
 
 
239 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  49.07 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  54.92 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  53.03 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  51.38 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  53.92 
 
 
228 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  53.27 
 
 
238 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  52.5 
 
 
256 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  53.54 
 
 
217 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  50 
 
 
276 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  53.47 
 
 
216 aa  206  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 
277 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  53.23 
 
 
259 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  51.79 
 
 
257 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  48.61 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  47.66 
 
 
234 aa  198  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  47.72 
 
 
209 aa  197  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  46.48 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.27 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  47.5 
 
 
220 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  47.5 
 
 
220 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  47.87 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  48.74 
 
 
218 aa  192  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  48.37 
 
 
235 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  47.74 
 
 
230 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  50.77 
 
 
241 aa  191  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.26 
 
 
216 aa  191  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  47.91 
 
 
237 aa  190  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  49.74 
 
 
222 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  50 
 
 
227 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  43.18 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  48.78 
 
 
234 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.23 
 
 
226 aa  188  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  47.24 
 
 
221 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  46.48 
 
 
208 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  47.03 
 
 
228 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  47.74 
 
 
285 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  47 
 
 
220 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  46.73 
 
 
225 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  45.62 
 
 
212 aa  185  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  46.5 
 
 
235 aa  184  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  43.75 
 
 
209 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  43.56 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  43.27 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  49 
 
 
245 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.06 
 
 
213 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.68 
 
 
218 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  48.17 
 
 
210 aa  181  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.72 
 
 
223 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.37 
 
 
278 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  46.26 
 
 
286 aa  179  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  44.24 
 
 
228 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  45.62 
 
 
222 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  42.67 
 
 
281 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  45.88 
 
 
212 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.45 
 
 
228 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  46.63 
 
 
212 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.22 
 
 
217 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  43.48 
 
 
214 aa  176  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  46.38 
 
 
215 aa  175  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  45.36 
 
 
215 aa  175  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  47.94 
 
 
218 aa  174  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  39.8 
 
 
210 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.18 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  41.59 
 
 
219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  43.48 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.05 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  43.54 
 
 
227 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  41.01 
 
 
213 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  47.59 
 
 
220 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  43.72 
 
 
218 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  43.6 
 
 
223 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  43.13 
 
 
223 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  43.28 
 
 
219 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  43.28 
 
 
219 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  42.36 
 
 
210 aa  168  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  42.25 
 
 
226 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  44.72 
 
 
267 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.1 
 
 
218 aa  167  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  43.94 
 
 
220 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  43.39 
 
 
229 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>