More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0399 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  100 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  66.5 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  65.17 
 
 		 213 aa  284  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  65.17 
 
 		 213 aa  284  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  64.47 
 
 		 203 aa  269  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  51.52 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.8 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.13 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.54 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.83 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.46 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  45.81 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.65 
 
 		 356 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.81 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.94 
 
 		 356 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.58 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.15 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.56 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  43.48 
 
 		 356 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  45 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.73 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  47.13 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.49 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.51 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.76 
 
 		 356 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.2 
 
 		 178 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  44.69 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  45.81 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.69 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.98 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  40 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  38.89 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  41.85 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  37.31 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  35.15 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  37.81 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  32.52 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  33.16 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.24 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  39.09 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  36.56 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  37.56 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  34.27 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.42 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  35.42 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  39.43 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.18 
 
 		 277 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  41 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  40.91 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  39.11 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  40.11 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  38.07 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  34.87 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  35.86 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  36.08 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.8 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  37.86 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  37.06 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  41.24 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  40.8 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  35.94 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  36.73 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  38.1 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.23 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  37.99 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  36.82 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.7 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  37.91 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.2 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  37.14 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.54 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  39.7 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  37.14 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  35 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  34.39 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  37.85 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.18 
 
 		 263 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  37.36 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  36.81 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  36.59 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.69 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.57 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  36.82 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  34.76 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  34.9 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  36.96 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  35.39 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  37.8 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  38.69 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  38.69 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.42 
 
 		 278 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  35.8 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  38.64 
 
 		 224 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  34.69 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  38.67 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.26 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  37.8 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  37.8 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  37.8 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  37.8 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>