More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0761 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  52.29 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.38 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  54.03 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  48.82 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  49.52 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.41 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.37 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  47.8 
 
 		 285 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  45.97 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  46.89 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  46.83 
 
 		 281 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  45.05 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  46.12 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  47.8 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  43.07 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  43.07 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  47.8 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.5 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  43.96 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.14 
 
 		 278 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  45.1 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  48.62 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  42.05 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.67 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.65 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.61 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  41.5 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.93 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.93 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  43.14 
 
 		 224 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  42.65 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  47.59 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  47.19 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  41.51 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  42.03 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  42.03 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  46.89 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.65 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  46.86 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  43.98 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.78 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  42.57 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  39.42 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.31 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.06 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  44.15 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  42.65 
 
 		 237 aa  165  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  40.87 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  41.46 
 
 		 291 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  42.78 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  40.57 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  43.02 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  45.05 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  41.95 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.75 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  46.07 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  40.1 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  45.51 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  43.89 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  45.71 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  43.56 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  45.14 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  43 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.66 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  45.2 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  39.8 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  42.13 
 
 		 286 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  46.99 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  40.1 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  45 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  41.29 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  39.41 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  43.63 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  44.57 
 
 		 267 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  37.56 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  37.56 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.11 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.71 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  43.01 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  39.6 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  41.38 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  40.49 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  43.28 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  42.08 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  42.54 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  39.91 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  39.91 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  41.85 
 
 		 276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  42.47 
 
 		 276 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  38.73 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  44.32 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  44.44 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  39.09 
 
 		 203 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  43.43 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.44 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  39.3 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  39.02 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  40.93 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.81 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>