More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0468 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  100 
 
 
210 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 
213 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  50.74 
 
 
223 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1026  EndoIII-related endonuclease  47.24 
 
 
209 aa  198  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.744613  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  48.5 
 
 
214 aa  198  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  48.51 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  49.01 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  47.03 
 
 
215 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  46.53 
 
 
215 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  46.53 
 
 
215 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  46.53 
 
 
215 aa  193  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  46.53 
 
 
215 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  46.53 
 
 
215 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  46.53 
 
 
215 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  45.54 
 
 
219 aa  189  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  46.46 
 
 
215 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  45.96 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  45.96 
 
 
215 aa  187  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  46.04 
 
 
219 aa  185  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  46.04 
 
 
219 aa  185  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  44.22 
 
 
220 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  44.67 
 
 
235 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  43.78 
 
 
211 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  43.39 
 
 
209 aa  178  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.41 
 
 
218 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  44.1 
 
 
251 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  46.39 
 
 
233 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  42.72 
 
 
237 aa  175  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  43.15 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  44.85 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.93 
 
 
258 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.01 
 
 
277 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  45.79 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  44.33 
 
 
220 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  44.33 
 
 
220 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  44.33 
 
 
209 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  43.46 
 
 
244 aa  168  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  44.1 
 
 
246 aa  168  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.93 
 
 
217 aa  168  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.93 
 
 
233 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  45.1 
 
 
228 aa  166  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  41.58 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  41.33 
 
 
230 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  41.21 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  42.56 
 
 
238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  44.27 
 
 
223 aa  164  8e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  40.82 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  44.39 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  42.93 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  40.1 
 
 
226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  41.75 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  42.29 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.39 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  44.02 
 
 
276 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.5 
 
 
263 aa  160  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  41.21 
 
 
213 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  42.19 
 
 
284 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  41.84 
 
 
216 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  42.93 
 
 
248 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  44.94 
 
 
216 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  45.51 
 
 
250 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  46.2 
 
 
216 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  41.71 
 
 
227 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  43.72 
 
 
234 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  42.11 
 
 
230 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  41.67 
 
 
235 aa  158  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  43.59 
 
 
256 aa  158  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.31 
 
 
226 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  41.92 
 
 
224 aa  157  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  42.86 
 
 
246 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.03 
 
 
223 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  45.11 
 
 
197 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.38 
 
 
216 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.38 
 
 
226 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  40.3 
 
 
210 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.31 
 
 
259 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  43.08 
 
 
267 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.39 
 
 
213 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.31 
 
 
259 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  43.58 
 
 
257 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  42.93 
 
 
218 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  41.12 
 
 
215 aa  155  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  40.53 
 
 
225 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  41.88 
 
 
260 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  41.88 
 
 
208 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  37.79 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  41.88 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.79 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  41.46 
 
 
236 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  41.21 
 
 
215 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  43.37 
 
 
254 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  42.7 
 
 
245 aa  154  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  42.11 
 
 
221 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  40.21 
 
 
218 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  40.64 
 
 
248 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  43.39 
 
 
224 aa  153  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.49 
 
 
243 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  41.75 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.37 
 
 
228 aa  152  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  40.93 
 
 
219 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>