More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3332 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  77.78 
 
 		 296 aa  447  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  43.53 
 
 		 268 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  37.55 
 
 		 228 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  34.98 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  35.98 
 
 		 228 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  28.75 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  33.58 
 
 		 232 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  35.23 
 
 		 228 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  40.11 
 
 		 220 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 		 226 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.33 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  45.31 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  31.48 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.57 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  32.63 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  29.32 
 
 		 223 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  44.71 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  41.53 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  33.05 
 
 		 223 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.19 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.73 
 
 		 237 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  38.85 
 
 		 223 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.69 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  29.96 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  34.32 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  39.29 
 
 		 222 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  42.94 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  27.83 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  34.78 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  41.44 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  41.44 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  28.1 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  32.91 
 
 		 218 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  32.79 
 
 		 216 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  43.04 
 
 		 217 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  29.36 
 
 		 220 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  28.94 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  32.56 
 
 		 232 aa  95.5  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 		 215 aa  95.5  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  35.76 
 
 		 222 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  39.31 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  28.12 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  27.4 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  27.94 
 
 		 221 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  36.69 
 
 		 222 aa  90.1  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  27.12 
 
 		 216 aa  89.4  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  39.86 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  28.95 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  32.72 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  30.26 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  26.79 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  26.79 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.63 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  26.56 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  33.33 
 
 		 216 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  29.29 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  24.04 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  26.74 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  24.31 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.36 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  25.26 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  24.32 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  24.4 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  24.87 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  32.1 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  26.54 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  30.37 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  32.1 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.69 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  24.23 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.62 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  32.14 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.56 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  27.06 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  27.06 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  39.22 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  23.56 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.65 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.81 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.3 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.74 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  26.45 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.43 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  34.09 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.09 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  29.32 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.32 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  27.73 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.82 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  31.34 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  25.57 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  25.96 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.64 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  28.4 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  25.23 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  27.94 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  24.66 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>