More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1407 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  73.52 
 
 
219 aa  323  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  71.23 
 
 
219 aa  315  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  54.93 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  56.34 
 
 
218 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  56.8 
 
 
209 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.93 
 
 
218 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.99 
 
 
218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.13 
 
 
220 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  57.14 
 
 
220 aa  237  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.41 
 
 
215 aa  236  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.87 
 
 
220 aa  221  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.95 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52 
 
 
227 aa  215  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.45 
 
 
356 aa  207  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.55 
 
 
356 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.91 
 
 
356 aa  206  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  45 
 
 
356 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.24 
 
 
357 aa  201  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  52.81 
 
 
204 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  48.35 
 
 
203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  41.35 
 
 
210 aa  185  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  46.27 
 
 
213 aa  185  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  46.27 
 
 
213 aa  185  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.12 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.69 
 
 
211 aa  181  7e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.63 
 
 
204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  43.26 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  45.51 
 
 
221 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  41.18 
 
 
223 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  41.76 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  42.61 
 
 
220 aa  161  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.09 
 
 
220 aa  161  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  37.07 
 
 
210 aa  156  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  39.66 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.27 
 
 
223 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  41.81 
 
 
213 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  42.46 
 
 
219 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.46 
 
 
219 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  41.24 
 
 
213 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  43.58 
 
 
222 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  42.46 
 
 
213 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  42.46 
 
 
213 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  42.46 
 
 
213 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  42.86 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  42.31 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  39.5 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  42.37 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  41.76 
 
 
239 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  41.48 
 
 
211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.41 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  41.24 
 
 
217 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  41.48 
 
 
211 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  41.48 
 
 
211 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  41.48 
 
 
211 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  41.48 
 
 
211 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  40.88 
 
 
224 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  42.05 
 
 
213 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  40.34 
 
 
211 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  40.68 
 
 
211 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  41.48 
 
 
213 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  41.81 
 
 
211 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.76 
 
 
268 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  41.38 
 
 
212 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  39 
 
 
254 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  41.24 
 
 
214 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  40.34 
 
 
211 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  41.24 
 
 
216 aa  147  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  41.85 
 
 
217 aa  147  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  40.11 
 
 
215 aa  147  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  40.62 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  40.11 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  40.91 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  40.11 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  40.91 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  40.66 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  40.91 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  40.11 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  37.36 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.34 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  40.68 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  41.76 
 
 
262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  39.34 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  36.6 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  40.34 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  40.66 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  41.21 
 
 
252 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  37.57 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  40.68 
 
 
214 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  42.31 
 
 
220 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  40.68 
 
 
214 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  37.7 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  40.78 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>