160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1226 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  96.05 
 
 		 228 aa  434  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  96.05 
 
 		 228 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  58.53 
 
 		 226 aa  255  5e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  45.5 
 
 		 222 aa  187  9e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  45.58 
 
 		 222 aa  187  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  44.98 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  46.84 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  39.69 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  38.5 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  33.49 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  34.42 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.2 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  33.95 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  40.88 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  38.12 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  34.64 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  32.67 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  34.31 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  36.13 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  31.02 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  35.75 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  32.09 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  35.76 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  37.17 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  31.6 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  34.24 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  36.19 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  31.94 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  37.02 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.41 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  31.79 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  31.79 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.07 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.33 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  34.21 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  32.71 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  31.02 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  31.72 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  31.72 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  31.09 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  30.73 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.89 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  31.64 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  27.37 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  29.02 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.75 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  32.35 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  28.33 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.28 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.2 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  26.98 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  35.21 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  33.51 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  26.47 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.67 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.5 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  30.81 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.25 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.96 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  30.77 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  28.65 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  28.65 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  24.87 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.53 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.55 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  25.11 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  27.84 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.63 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.97 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  25.68 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  26.03 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.73 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.16 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  25.81 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.62 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.92 
 
 		 356 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  27.18 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  22.78 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  30.16 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  28.46 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  26.92 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  26.97 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  23.85 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  28.87 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  27.5 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  32.03 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  32.03 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  28.67 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  28.87 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.41 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.64 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.11 
 
 		 356 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>