More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1327 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 218 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  63.76 
 
 		 218 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  56.42 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.42 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.27 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  55.91 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.25 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  57.42 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.99 
 
 		 220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.42 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.61 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.04 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.43 
 
 		 356 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.49 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.29 
 
 		 356 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  49.71 
 
 		 356 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.7 
 
 		 357 aa  192  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.7 
 
 		 356 aa  185  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.45 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  49.15 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  43.58 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  41.58 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.81 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  44.57 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  44.57 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.06 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  40.54 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.64 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.2 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  34.18 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.88 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  34.43 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  36.52 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  38.07 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.7 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  36.17 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  36.81 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  38.22 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  34.97 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  36.93 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  37.78 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  37.08 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.08 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  35.83 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  34.93 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  31.88 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  35.64 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  34.41 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  34.62 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  37.22 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  35.14 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  35.14 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  34.59 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.81 
 
 		 277 aa  124  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  32.45 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  36.78 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  32.78 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  34.92 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  36.21 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  34.05 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  36.36 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  32.66 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  36.36 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  33.33 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  31.5 
 
 		 285 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  34.08 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  36.17 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  32.78 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  32.45 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.14 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  32.22 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  34.44 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  32.96 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  32.04 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  33.52 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  36.11 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.7 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.89 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  32.09 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  34.04 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.33 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  32.98 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  33.97 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  33.52 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  34.64 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.08 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  31.87 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  35.42 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.52 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  33.9 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>