More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0307 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  92.24 
 
 		 232 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  89.66 
 
 		 232 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  70.13 
 
 		 232 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  61.06 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  53.07 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.78 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.06 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  39.48 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  45.95 
 
 		 213 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  42.52 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  41.23 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  35.86 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  36.64 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  35.32 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  36.05 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  37.39 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.97 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  34.55 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  36.91 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  34.78 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  34.35 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  35.32 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  36.36 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  39.89 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.39 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  48.09 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  34.31 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  34.71 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  32.78 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  38.14 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  37.71 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  36.82 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  35.81 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  36.05 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  37.44 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  31.49 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  31.49 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  40.2 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  34.35 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  32.19 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.77 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.51 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  31.74 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  36.87 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.74 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  34.86 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  37.43 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  39.66 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  35.1 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  34.8 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  35.2 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  27.6 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  35.33 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  29.39 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  29.39 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  38.12 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  37.02 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  29.07 
 
 		 268 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  28.57 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  37.57 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  32.97 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  22.39 
 
 		 296 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.79 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  28.95 
 
 		 297 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  31.32 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31.32 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.84 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  32.58 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  23.85 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.02 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.95 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  27.43 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  26.82 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.81 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.22 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  26.26 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  29.71 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.75 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.11 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.82 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  24.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  24.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  24.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  24.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  24.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  24.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  24.02 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  32.87 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  32.87 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  29.94 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  27.06 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  27.06 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  32.43 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  29.94 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>