More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1039 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  45.37 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  44.24 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  42.86 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  43.27 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.23 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  40.76 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  41.04 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  40.28 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  43.88 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  39.72 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  39.71 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  40.49 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  35.78 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  38.68 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.28 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  37.38 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  41.29 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  41.71 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  39.62 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  39.62 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  37.26 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  39.05 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  36.92 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  37.38 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.28 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  37.8 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  33.17 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  36.41 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  34.31 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.18 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  36.32 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  37.22 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  34.85 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  36.79 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  36.02 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  31.8 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  34.58 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  28.51 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  33.85 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  32.81 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  32.81 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  26.84 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  33.77 
 
 		 268 aa  121  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  27.27 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  27.63 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  31.02 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.17 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  35.37 
 
 		 297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  34.83 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.81 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.77 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  31.03 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  32.82 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  27.75 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  37.19 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.82 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  29.61 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  27.84 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.5 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  29.33 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.78 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  28.8 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  27.32 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  24.64 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  25.35 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  22.32 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  26.47 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.63 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  27.63 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  28.22 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  28.17 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.21 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  26.34 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  26.87 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.39 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.75 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.4 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  28.42 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  23.79 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.96 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  24.62 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  25.37 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  25.95 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  24.62 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  25.12 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.94 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  25.12 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  24.88 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  28.34 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  28.34 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.94 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  26.32 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>