More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1358 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  78.64 
 
 		 220 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  79 
 
 		 223 aa  357  7e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  54.55 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  49.77 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  51.39 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  52.53 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  51.6 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  51.63 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  56.34 
 
 		 217 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  51.39 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  51.44 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  53.66 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  50.48 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  51.17 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  54.15 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  50.24 
 
 		 257 aa  208  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  45.54 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  47.14 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  43.4 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.24 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  49.28 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  45.45 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  47.62 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  47.62 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  45.85 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  42.31 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  44.81 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  46.7 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  47.14 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43.44 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  45 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  42.93 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43.13 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  44.17 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  41.31 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  39.91 
 
 		 220 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.26 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  42.13 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  42.42 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  35.02 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  34.55 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.02 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  35.02 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  41.95 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  38.86 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  35.8 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  36.79 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.24 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  34.91 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  34.91 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  37.8 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  35.32 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  31.02 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  37.04 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  36.65 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  33.05 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  35.94 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  35.29 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.99 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  33.66 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  31.6 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  31.6 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  30.66 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  32.32 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.29 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  32.51 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.32 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.66 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  34.95 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  30.77 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.64 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  29.41 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  31.72 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  26.89 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  29.15 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.84 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  29.17 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.71 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.37 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  25.79 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.75 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  26.87 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  25.35 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.74 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.03 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  25.35 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  30.93 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.53 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  28.35 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  22.44 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.73 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  28.57 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  27.05 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  24.89 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.87 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.23 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  29.9 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>