173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0740 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  100 
 
 
221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  54.84 
 
 
216 aa  236  3e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  50.89 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  50.23 
 
 
221 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  47.27 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  44.98 
 
 
228 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  43.33 
 
 
228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  43.81 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  41.46 
 
 
226 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  39.81 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  39.36 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  38.97 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 
250 aa  123  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  38.07 
 
 
228 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  39.78 
 
 
228 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  38.34 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  38.34 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  37.82 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  40.4 
 
 
216 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  38.61 
 
 
223 aa  118  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  35.57 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.98 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.83 
 
 
223 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  38.1 
 
 
228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  42.93 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 
223 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  38.8 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  35.81 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  33.33 
 
 
220 aa  108  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  36.92 
 
 
220 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  37.82 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  35.9 
 
 
220 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  34.95 
 
 
223 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  34.8 
 
 
232 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  30.8 
 
 
296 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  34.48 
 
 
213 aa  102  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  31.66 
 
 
226 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.31 
 
 
232 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  34.92 
 
 
219 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  32.8 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  34.59 
 
 
223 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  35.87 
 
 
206 aa  99  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.78 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  36.17 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  35.45 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.15 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  34.48 
 
 
234 aa  95.9  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  28.12 
 
 
297 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  32.54 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  38.35 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  34.24 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.07 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  33 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  32.42 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  31.02 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  31.22 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  30.27 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.32 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  27.31 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  29.52 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  31.49 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  28.19 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.84 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  30 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  31.29 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.7 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.23 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  25.74 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  29.74 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.5 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  29.41 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  25.43 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  27.1 
 
 
269 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.63 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.95 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  28.07 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  32.48 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.92 
 
 
356 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  24.63 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  24.63 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  27.15 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.87 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  27.47 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.67 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.17 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.42 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.33 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  25.3 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.45 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  32.26 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  26.4 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.53 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  26.37 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.17 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  26.67 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.06 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>