More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0651 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  37.9 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.29 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  34.36 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  33.85 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.96 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  34.9 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  36.45 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  36.46 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  32.34 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  35.38 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  32.51 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  34.72 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  32.83 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  34.5 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.31 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  31.7 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  31.7 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  35.2 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  35.11 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  29.95 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  30.3 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.26 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  27.75 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  29.95 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  29.85 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.82 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  29 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  29.38 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.02 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  28 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  32.65 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  28.57 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.85 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  26.56 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  30.89 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  29.41 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  27.94 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  28.77 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  30.35 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  29.52 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  28.71 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  26.28 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  31.31 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  30.21 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  29.06 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.73 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  29.12 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.7 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  28.34 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  28.34 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  28.96 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  30.88 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  28.29 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  26.87 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.77 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  28.57 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0785  HhH-GPD  33.33 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  28.02 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  29.46 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.2 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  28.22 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  24.73 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  25.41 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  25.99 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  26.64 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  28.41 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  26.24 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  27.13 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  27.5 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  27.97 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  26.2 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.49 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  25.33 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  24.46 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5680  HhH-GPD family protein  26.63 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  24.08 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  23.32 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  25 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  25.23 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  22.8 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  26.37 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  26.06 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  26.06 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  25.53 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  24.38 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  26.06 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  25.53 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.11 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  24.5 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  23.32 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.57 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  26.73 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  27.42 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  26.11 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>