176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0640 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  96.49 
 
 
228 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  96.05 
 
 
228 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  58.06 
 
 
226 aa  254  6e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  46.02 
 
 
222 aa  187  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  45.05 
 
 
222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  43.33 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  48.07 
 
 
216 aa  156  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  41.75 
 
 
221 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  38.5 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  38.67 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  33.79 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  38.12 
 
 
220 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  33.95 
 
 
228 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  34.64 
 
 
222 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  33.49 
 
 
228 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  39.78 
 
 
225 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.06 
 
 
223 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  37.17 
 
 
225 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  34.01 
 
 
217 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 
216 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  29.17 
 
 
221 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  35.24 
 
 
213 aa  102  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  37.43 
 
 
216 aa  101  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  30.66 
 
 
223 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  35.24 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  37.16 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  32.92 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  29.41 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  31.31 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 
232 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  35.37 
 
 
223 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  35.37 
 
 
223 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  31.94 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.96 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  34.62 
 
 
224 aa  92  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.98 
 
 
221 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  32.71 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  31.72 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  31.72 
 
 
218 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.77 
 
 
257 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.8 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  29.95 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  30.21 
 
 
232 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  30.85 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  31.58 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  27.93 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.27 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  31.07 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  28.79 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  28.33 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  29.12 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.05 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31.11 
 
 
222 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.33 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  26.42 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.4 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  33 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  27.5 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  31.79 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  30.81 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  31.47 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.68 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  30.22 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  25.37 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  27.89 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  27.89 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.09 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  24.23 
 
 
297 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.37 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.22 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.85 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  22.42 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  26.71 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  27.45 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  25.16 
 
 
268 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  22.61 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.46 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.57 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.28 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  30.16 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  24.73 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  26.52 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.21 
 
 
356 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.82 
 
 
214 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  23.42 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  28.46 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  31.3 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  28.02 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  26.63 
 
 
276 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  25.39 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.04 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  24.62 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.58 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.74 
 
 
356 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  24.86 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  33.07 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  32.03 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>