More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2595 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  83.08 
 
 		 278 aa  417  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  74.81 
 
 		 270 aa  394  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  70.33 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.56 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  36.02 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  33.8 
 
 		 219 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  36.89 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.99 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  36.74 
 
 		 222 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  30.77 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  32.89 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.66 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.04 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  32.75 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  34.36 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.11 
 
 		 204 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  32.42 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  36.59 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.47 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  33.33 
 
 		 214 aa  96.3  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  31.12 
 
 		 212 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  34.6 
 
 		 218 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  31 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.75 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  31.3 
 
 		 219 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  32.13 
 
 		 211 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  32.58 
 
 		 223 aa  94  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  33.33 
 
 		 230 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  29.68 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  29.68 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  31.42 
 
 		 212 aa  92.4  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.91 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  32.9 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  33.01 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  29.55 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  33.01 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  32.57 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  31.72 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  29.9 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.97 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  32.44 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  32.5 
 
 		 214 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  28.05 
 
 		 204 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  32.88 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.05 
 
 		 213 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 		 657 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  27.66 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.06 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  35.53 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  31.98 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  28 
 
 		 215 aa  86.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  26.15 
 
 		 223 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  34.22 
 
 		 216 aa  86.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  32.69 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33 
 
 		 232 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  31.98 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  31.42 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.01 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  30.84 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  32.83 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.26 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.25 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  32.16 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  34.19 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  32.34 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  32.43 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.57 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  27.85 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  30.09 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  29.47 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  29.15 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  31.63 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  31.03 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  28.63 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  27 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  32.49 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  29.65 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.82 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  30.77 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  25.33 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.4 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  32.17 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.16 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  32.51 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  27 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  27 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  27 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  27 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  27 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  30.2 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  27.36 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.28 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  27 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  31.51 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.66 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  29.15 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  29.13 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  31.31 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>