More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0971 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  55.07 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  46.08 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.95 
 
 		 223 aa  184  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  43.12 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  45 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  45.41 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  43.89 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  43.89 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  42.53 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  46.3 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  42.01 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  43.58 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  46.12 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  45.95 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  42.27 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.23 
 
 		 237 aa  165  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  45.09 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  39.73 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.07 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  40.18 
 
 		 250 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  43.89 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  42.54 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  35.11 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  40.49 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43.89 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  38.53 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  40 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  38.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  40 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  39.63 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  36.7 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  40.09 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  36.53 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  36.53 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  38.71 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  34.93 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  32.87 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  40.74 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  37.73 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  40.53 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.8 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  34.1 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  41.88 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.35 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  37.14 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  36.54 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  39.27 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  34.1 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  35.75 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  33.82 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  37.84 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  39.77 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  37.17 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  28.1 
 
 		 297 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  35.24 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  34.48 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.69 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  33.99 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  33.5 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  28.1 
 
 		 296 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  33.83 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  33.83 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  30.73 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  29.9 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  28.26 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  29.35 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.95 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.89 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.17 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  26.5 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  29.12 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  29.12 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  29.86 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  26.84 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5680  HhH-GPD family protein  28.8 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  28.47 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.02 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  27.32 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  26.34 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  27.05 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  27.27 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  26.74 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.43 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  26.09 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  29.78 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  28.43 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.93 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  25.42 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  24.46 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  24.18 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.82 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  27.68 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  25 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>