290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2873 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  100 
 
 
268 aa  541  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  43.53 
 
 
297 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  43.12 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  42.44 
 
 
222 aa  145  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.71 
 
 
257 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  38.36 
 
 
228 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  35.8 
 
 
223 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  37.9 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  39.04 
 
 
220 aa  135  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  38.89 
 
 
223 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  38.97 
 
 
225 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  34.82 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  38.39 
 
 
250 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  39.51 
 
 
228 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.29 
 
 
237 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 
216 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 
225 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.79 
 
 
223 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  38.57 
 
 
232 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  36.41 
 
 
222 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  35.38 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.77 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  38.05 
 
 
216 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  34.1 
 
 
213 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  38.18 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  34.55 
 
 
220 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  31.15 
 
 
216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  39.72 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  35.68 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  39.72 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  34.3 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  32.9 
 
 
220 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  29.91 
 
 
206 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.51 
 
 
221 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  38.14 
 
 
221 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  31.92 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  35.24 
 
 
234 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  37.96 
 
 
226 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  36.61 
 
 
223 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  37.26 
 
 
217 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 
232 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  29.9 
 
 
211 aa  99  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  25.82 
 
 
227 aa  97.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  29.07 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  31.55 
 
 
225 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  34.55 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.19 
 
 
232 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  32.84 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  30 
 
 
232 aa  92  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.22 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  34.45 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  32.95 
 
 
216 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  27.31 
 
 
232 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  30.24 
 
 
222 aa  86.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.44 
 
 
221 aa  86.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  27.18 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  27.18 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.3 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.77 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  22.96 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  31.49 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  28.72 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.26 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  30.77 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  27.06 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  27.06 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  30.82 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.35 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  23.77 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  26.51 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  32.03 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  26.51 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  28.18 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.53 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.43 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  25.67 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.64 
 
 
222 aa  62.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.95 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  25.56 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.6 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  26.28 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  27.88 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  31.58 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  39.29 
 
 
245 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.22 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.02 
 
 
213 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.13 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  29.37 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.5 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  22.17 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  28.33 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  31.96 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  25.16 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  31.13 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  32.06 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  25.81 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.4 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.49 
 
 
356 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  31.72 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>