More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0292 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 227 aa  456  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  45.83 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  37.9 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  35.75 
 
 		 213 aa  112  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  38.71 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  34.87 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  36.82 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  31.16 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  34.5 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  34.2 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  33.5 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  33.99 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.16 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  32.32 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  29.38 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  25.82 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  32.81 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  31.22 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  29.44 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  31.28 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.65 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  30.93 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  31.19 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  30.96 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  30.05 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  30.05 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  31.12 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  31.72 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  27.1 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  28.28 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  27.84 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  28.63 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  30.3 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  28.64 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  28.14 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.5 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.05 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  28.8 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.4 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  30.26 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  25 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.42 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  27.86 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  24.31 
 
 		 297 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  31.82 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  30.95 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.27 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  22.32 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  32.58 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  26.44 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.02 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  27.42 
 
 		 203 aa  72  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  26.63 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.69 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  26.63 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  30.9 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  26.92 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  31.68 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  27.89 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.05 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.67 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  31.29 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.01 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  26.25 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  30.25 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.5 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  28.29 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  28.37 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.38 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  29.17 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  27.54 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.61 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  24.85 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  27.46 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.37 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  27.69 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  26.95 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  28.8 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.49 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.45 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.45 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  24.31 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.97 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  24.35 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.42 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  27.67 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  30.43 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  25.27 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  27.45 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  30.68 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  26.74 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  28.38 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  26.34 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  26.71 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  27.27 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  27.27 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>