More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0846 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  49.3 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  52.63 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  48.74 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  50 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  44.88 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  48.78 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  48.29 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  44.08 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  49.02 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  49.47 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  46.73 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  44.29 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  42.93 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  50.26 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  47.32 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  42.93 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  45.45 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  43.65 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  43.63 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  40.57 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  44.04 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  45.23 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  46.19 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  41.92 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  41.46 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  40.1 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  41.62 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  45.75 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  44.44 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  42.58 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.85 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  44.83 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  42.54 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  43.43 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  37.55 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  40.61 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  37.56 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  40.41 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.28 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  38.92 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  35.81 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.85 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  39.04 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  36.23 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  30.56 
 
 		 296 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  35.92 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  35.92 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  29.32 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  40.11 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.05 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  39.22 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  34.65 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  38.61 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  37.43 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  38.5 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  37.31 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  37.97 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  38.5 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  34.3 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  34.04 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  36.59 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  33.68 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  32.29 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  35.2 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  31.19 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.09 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.95 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.5 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.2 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.89 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  30.15 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  28.27 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  31.08 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  31.08 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  29.95 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  28.21 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.12 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.12 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  26.7 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.62 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  26.26 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.82 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  25.82 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  28.26 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.87 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  26.92 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  25.82 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.04 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  25.63 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  24.88 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  25 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  27.32 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  25.26 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  26.88 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  27.32 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  27.32 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>