More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0376 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  58.9 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  61.72 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  56.8 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  57.67 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  58.85 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  55.24 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  52.11 
 
 		 223 aa  224  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  52.58 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  54.73 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  52.2 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  51.17 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  48.61 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  52.66 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  48.56 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  51.67 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  50.69 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  52.24 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  53.54 
 
 		 218 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  50.96 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  48.29 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  52.97 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  51.89 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  51.89 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  49.77 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  44.08 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  50.7 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  47.62 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  45.54 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  43.07 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  45.21 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  44.29 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  41.06 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.15 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  41.86 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.68 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.82 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  37.93 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  37.39 
 
 		 232 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  43.85 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  39.63 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.05 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  35.65 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.32 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  38.79 
 
 		 268 aa  134  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  35.42 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  44.71 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  37.98 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  37.63 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  36.17 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  40.84 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  36.95 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  36.6 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  42.93 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  37.86 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  37.02 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  37.7 
 
 		 216 aa  118  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.94 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  34.03 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  34.11 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  36.22 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  34.36 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  32.71 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  32.71 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.82 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.91 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.25 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  32.58 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  28.28 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  33.66 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.91 
 
 		 236 aa  88.6  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  31.31 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.83 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  31.37 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.66 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.33 
 
 		 274 aa  85.5  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  31.44 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  29.63 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  29.63 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  28.17 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.55 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  27.23 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  28.64 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.29 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.09 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.53 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  29.28 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  27.36 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  27.6 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  27.6 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.08 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.53 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  28.28 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  27.06 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  27.73 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  29.25 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>