More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1733 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 241 aa  507  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  47.11 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  46.98 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.83 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.2 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  41.33 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  40.27 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.33 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  39.82 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  39.32 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  34.47 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.75 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  34.3 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  33.01 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.65 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1412  HhH-GPD family protein  31.7 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  34.02 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0785  HhH-GPD  32.35 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.65 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  30.18 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  32.47 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  33.16 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  33.16 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  35.05 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  31.79 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  31.92 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  32.29 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  32.52 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  30.81 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  31.44 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  32.83 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  32.12 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  30.41 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  32.99 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  31.19 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  30.99 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  31.98 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.41 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 		 657 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  31.82 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  28.51 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  31.47 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  30.14 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  30.93 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.8 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  29.38 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  32.46 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  29.65 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.09 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  26.16 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  33.5 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.46 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.84 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  30.73 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  28.96 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  29.23 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  32.72 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.64 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.17 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  29.67 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  31.67 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  31.98 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.17 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  29.23 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  29.8 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  30.1 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  29.19 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.21 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  28.94 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  28.43 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.65 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  32.34 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  28.18 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.5 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  28.21 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  26.03 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  36.73 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  37.76 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.49 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  32.99 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.18 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  30.61 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.09 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  29.53 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  36.73 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  28.95 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  28.95 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  28.95 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  28.95 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  28.95 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  28.95 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  27.1 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.28 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  28.7 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  31.41 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.84 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  29.02 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>