More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1101 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  57.14 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  51.78 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  51.78 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  53.11 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  50.54 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.14 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  48.74 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.18 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.84 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.56 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.12 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.63 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.28 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.17 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  46.11 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.67 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  47.54 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.56 
 
 		 357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  48.07 
 
 		 356 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.51 
 
 		 356 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.07 
 
 		 356 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  47.51 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.02 
 
 		 356 aa  174  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  43.17 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.26 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.2 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  42.93 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  41.71 
 
 		 215 aa  167  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  43.94 
 
 		 223 aa  167  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  37.88 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.09 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  37.13 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.5 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  38.89 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  38.89 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  37.37 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  39.49 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  38.89 
 
 		 260 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  39.7 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.88 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  38.89 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  39.59 
 
 		 224 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  38.5 
 
 		 285 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  37.88 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  39.5 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  39.2 
 
 		 248 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  36.14 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  39.8 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  39 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  40 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  39.2 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  38.78 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  39.2 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  36.36 
 
 		 252 aa  151  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  38.69 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  39.8 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  38.97 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.5 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.38 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  37.95 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  41.71 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  39.58 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  35.35 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  35.29 
 
 		 216 aa  148  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  36.87 
 
 		 240 aa  148  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  35.18 
 
 		 234 aa  147  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  37.44 
 
 		 223 aa  147  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  37.31 
 
 		 234 aa  147  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  35.47 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  37.06 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  37.19 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  36.36 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.83 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  38.38 
 
 		 262 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  38.78 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  36.82 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  35.38 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  35.86 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  38.46 
 
 		 281 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  37.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.88 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  37.43 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  35.64 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  38.1 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  38.1 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  38.1 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  38.1 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  38.1 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  38.1 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.19 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  38.62 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  35.35 
 
 		 258 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  35.82 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  36.18 
 
 		 228 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  38.27 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  37.57 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  36.32 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>